RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 TSPAN18Q96SJ8 248 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 CGRRF1Q99675 332 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 TSG101Q99816 390 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 EPN3Q9H201 632 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 INTS13Q9NVM9 706 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 DPP3Q9NY33 737 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 RWDD2AQ9UIY3 292 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 DSEQ9UL01 958 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 DERAQ9Y315 318 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 C2CD2Q9Y426 696 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 RAD54BQ9Y620 910 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 BICDL2A1A5D9 508 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 LEFTY2O00292 366 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 CETN3O15182 167 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 MPOP05164 745 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 CKMP06732 381 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 TRIM49P0CI25 452 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 TRIM49CP0CI26 452 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 CSH1P0DML2 217 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 CSH2P0DML3 217 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 DLATP10515 647 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 CYP2F1P24903 491 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 RPL13P26373 211 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 TSPY1Q01534 308 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 STX1AQ16623 288 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 CCDC142Q17RM4 750 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 SASS6Q6UVJ0 657 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 NT5DC4Q86YG4 428 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 WDR49Q8IV35 697 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 FAM186BQ8IYM0 893 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 KIAA1958Q8N8K9 716 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 C1orf127Q8N9H9 656 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 SAP25Q8TEE9 199 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 CCDC127Q96BQ5 260 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 VCPIP1Q96JH7 1222 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 MTMR12Q9C0I1 747 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 SIX4Q9UIU6 781 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 MYH10P35580 1976 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 HIVEP1P15822 2718 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 PLXNA2O75051 1894 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 KPNA7A9QM74 516 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 WASH3PC4AMC7 463 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 TULP3O75386 442 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 CST3P01034 146 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 ITGB3P05106 788 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 FAM87AP0C7U9 286 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 TNNI1P19237 187 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 TNFRSF8P28908 595 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 GRIA4P48058 902 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 LSSP48449 732 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 VAMP7P51809 220 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 PPP3CAQ08209 521 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 SMARCB1Q12824 385 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 ILKQ13418 452 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 NNTQ13423 1086 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 NCAPHQ15003 741 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 SURF1Q15526 300 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 SCN4BQ8IWT1 228 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 PDCL2Q8N4E4 241 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 SVOPQ8N4V2 548 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 TERB1Q8NA31 727 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 EXTL1Q92935 676 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 CEP63Q96MT8 703 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 HSD3B7Q9H2F3 369 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 TM9SF3Q9HD45 589 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 ANO10Q9NW15 660 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 L1RE1Q9UN81 338 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf135-204ENST00000495399 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.5 ms