RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 CCHCR1Q8TD31 782 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 P3H4Q92791 437 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 E2F7Q96AV8 911 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 SLC40A1Q9NP59 571 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 COX16Q9P0S2 106 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CHMP2BQ9UQN3 213 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PCDH15Q96QU1 1955 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PPM1 405 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 AVILO75366 819 aa7.26□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 ARHGEF15O94989 841 aa7.26□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 INCA1Q0VD86 236 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 SMARCB1Q12824 385 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 SOWAHAQ2M3V2 549 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CCDC14Q49A88 953 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa7.26□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 TTC13Q8NBP0 860 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 TSC22D3Q99576 134 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 APOC2P02655 101 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 SCNN1BP51168 640 aa7.25□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 DPYSL3Q14195 570 aa7.25□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 NOTUMQ6P988 496 aa7.25□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 PALM2Q8IXS6 379 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.25□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 BATF3Q9NR55 127 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 IGSF9Q9P2J2 1179 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 SHOC2Q9UQ13 582 aa7.25□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 ALOX15BO15296 676 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 KCNN4O15554 427 aa7.25□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 GPX6P59796 221 aa7.25□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 MAML1Q92585 1016 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 FAM149B1Q96BN6 582 aa7.25□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 BLOC1S6Q9UL45 172 aa7.25□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa7.25□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 SDHBP21912 280 aa7.25□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 IGDCC3Q8IVU1 814 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PDIK1LQ8N165 341 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 FBF1Q8TES7 1133 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 NSMCE1Q8WV22 266 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 ZFP42Q96MM3 310 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.25□□□□□ -1.25
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