RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491954.5

CIZ1-223, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 3

Gene CIZ1, Length 955 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-223	ENST00000491954	FAM187A	A6NFU0	413 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF487	B1APH4	448 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	XYLB	O75191	536 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	ABLIM3	O94929	683 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	ATF2	P15336	505 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	ELF1	P32519	619 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	FNTA	P49354	379 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	DR1	Q01658	176 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	RAB33A	Q14088	237 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	KAZN	Q674X7	775 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	BNIPL	Q7Z465	357 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	ATL2	Q8NHH9	583 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	FAM71B	Q8TC56	605 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	RNF139	Q8WU17	664 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	FGF13	Q92913	245 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	PEBP4	Q96S96	227 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	NELL2	Q99435	816 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	CALN1	Q9BXU9	219 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	RAB17	Q9H0T7	212 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	STIM2	Q9P246	746 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	AMACR	Q9UHK6	382 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	COL4A3	Q01955	1670 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	OBSL1	O75147	1896 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	FAM92A	A1XBS5	289 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	CCDC151	A5D8V7	595 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	RAD51C	O43502	376 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	CST8	O60676	142 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	KRT10	P13645	584 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	CD72	P21854	359 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	ARSE	P51690	589 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	NTHL1	P78549	312 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	NME3	Q13232	169 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	LLGL1	Q15334	1064 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	DPYSL2	Q16555	572 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	ST3GAL2	Q16842	350 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	MAP9	Q49MG5	647 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	RFX6	Q8HWS3	928 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	EDEM1	Q92611	657 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	NTAN1	Q96AB6	310 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	DCLK3	Q9C098	648 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	WDCP	Q9H6R7	721 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	RAB23	Q9ULC3	237 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	FZD10	Q9ULW2	581 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	CCL16	O15467	120 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	ADAM12	O43184	909 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	C8A	P07357	584 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	HOXA9	P31269	272 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	ADRA1B	P35368	520 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	ALDH1A3	P47895	512 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	CXCR3	P49682	368 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	GPR15	P49685	360 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC7A5	Q01650	507 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	PPP2R5D	Q14738	602 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	RAB6C	Q53S08	254 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	EFHC2	Q5JST6	749 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	BBS12	Q6ZW61	710 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	FAM131B	Q86XD5	332 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CIZ1-223	ENST00000491954	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms