RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490205.1

NELFCD-210, Transcript of negative elongation factor complex member C/D, humanhuman

TSL 2

Gene NELFCD, Length 650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCD-210ENST00000490205 SLC5A9Q2M3M2 681 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 GGT6Q6P531 493 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 SYTL1Q8IYJ3 562 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 OR1N1Q8NGS0 311 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 SNX27Q96L92 541 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 CTAGE1Q96RT6 745 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 WDR24Q96S15 920 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 TMEM204Q9BSN7 226 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ARFGAP3Q9NP61 516 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 FSCN3Q9NQT6 498 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ASNSD1Q9NWL6 643 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 PCDHA12Q9UN75 941 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 PROCRQ9UNN8 238 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 LGALS16A8MUM7 142 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 PRSS44E7EML9 344 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 NPC1O15118 1278 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 TNFRSF6BO95407 300 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 MATN1P21941 496 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 SLC5A2P31639 672 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 PGGT1BP53609 377 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 TNFAIP2Q03169 654 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 BTKQ06187 659 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 STARD3Q14849 445 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 MAPKAPK3Q16644 382 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 FAXCQ5TGI0 409 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 LIN54Q6MZP7 749 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 TMEM199Q8N511 208 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 STYXQ8WUJ0 223 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 KAT2BQ92831 832 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 MUL1Q969V5 352 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 VPS33BQ9H267 617 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ZBTB26Q9HCK0 441 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 OBP2BQ9NPH6 170 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 NECTIN3Q9NQS3 549 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 TMOD4Q9NZQ9 345 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ANAPC4Q9UJX5 808 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 DTNAQ9Y4J8 743 aa3.99□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 A0A1W2PPC1 479 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 PRYO14603 147 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 PIP5K1BO14986 540 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 COQ9O75208 318 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 DRD1P21728 446 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 MMP8P22894 467 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ZXDBP98169 803 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 PPATQ06203 517 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 GPS1Q13098 491 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 GAB1Q13480 694 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 BFSP2Q13515 415 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 TRIM14Q14142 442 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 DLGAP5Q15398 846 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF585BQ52M93 769 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 MRNIPQ6NTE8 343 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 CCDC174Q6PII3 467 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 USP17L6PQ6QN14 398 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 DLK2Q6UY11 383 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ASB5Q8WWX0 329 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 FZD3Q9NPG1 666 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 TM7SF3Q9NS93 570 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 RXFP3Q9NSD7 469 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 CEP83Q9Y592 693 aa3.98□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa3.97□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 C4orf47A7E2U8 309 aa3.97□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 M0QZQ0 153 aa3.97□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 FFAR2O15552 330 aa3.97□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ASNA1O43681 348 aa3.97□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 SLC28A2O43868 658 aa3.97□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ENO1P06733 434 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 NDUFS1P28331 727 aa3.97□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 KCNJ4P48050 445 aa3.97□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 SOX2P48431 317 aa3.97□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 POLD2P49005 469 aa3.97□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF84P51523 738 aa3.97□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ATP1A4Q13733 1029 aa3.97□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 SPARCL1Q14515 664 aa3.97□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 PTGR1Q14914 329 aa3.97□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 KRT72Q14CN4 511 aa3.97□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 PFKFB4Q16877 469 aa3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms