RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487625.1

USP9X-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 9 X-linked, human

TSL 2

Gene USP9X, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP9X-208	ENST00000487625	VPS4A	Q9UN37	437 aa		2.58	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		2.58	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		2.58	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625		F8W810	466 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	BMPR1B	O00238	502 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	SLC16A5	O15375	505 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	UGDH	O60701	494 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	CBFA2T3	O75081	653 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	INMT	O95050	263 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	MYF5	P13349	255 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	PBX1	P40424	430 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	KCNJ4	P48050	445 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	SOX2	P48431	317 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	VPS41	P49754	854 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	EPHB1	P54762	984 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	SLC12A2	P55011	1212 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	CNGA3	Q16281	694 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	MZT2A	Q6P582	158 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	FAM227B	Q96M60	508 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	THSD1	Q9NS62	852 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625		F8W8V4	182 aa		2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	MT-ND5	P03915	603 aa		2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	TFEB	P19484	476 aa		2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	NDUFS1	P28331	727 aa		2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	PGM5	Q15124	567 aa		2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	RNF220	Q5VTB9	566 aa		2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	EME1	Q96AY2	570 aa		2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	APIP	Q96GX9	242 aa		2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625		A0A087WZ62	844 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625		A6NNC1	897 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	USP12	O75317	370 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	SCGB1D2	O95969	90 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	CFC1B	P0CG36	223 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	CFC1	P0CG37	223 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	AR	P10275	920 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	CHRNB1	P11230	501 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	PRG2	P13727	222 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	HOXD12	P35452	270 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	PCYT1A	P49585	367 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	ZNF84	P51523	738 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	DGKQ	P52824	942 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	CACNB3	P54284	484 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	KCNJ12	Q14500	433 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	GJA10	Q969M2	543 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	SNX22	Q96L94	193 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	WDR24	Q96S15	920 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	PKP4	Q99569	1192 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		2.55	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		2.54	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	PLSCR5	A0PG75	271 aa		2.54	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	ANKRD62	A6NC57	917 aa		2.54	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		2.54	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	TPP1	O14773	563 aa		2.54	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	BUB3	O43684	328 aa		2.54	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	IL18RAP	O95256	599 aa		2.54	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	DRD1	P21728	446 aa		2.54	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	PEX2	P28328	305 aa		2.54	□□□□□ -2
USP9X-208	ENST00000487625	DUSP1	P28562	367 aa		2.54	□□□□□ -2

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