RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 GLG1Q92896 1179 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 ZNF558Q96NG5 402 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 KLHL5Q96PQ7 755 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 RMDN3Q96TC7 470 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 ADAM2Q99965 735 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 ZBP1Q9H171 429 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 SFXN1Q9H9B4 322 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 IFT122Q9HBG6 1241 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 IL17RBQ9NRM6 502 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 PARPBPQ9NWS1 579 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 SPG21Q9NZD8 308 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 CLUHO75153 1309 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 NRCAMQ92823 1304 aa4.96□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 MYO9AB2RTY4 2548 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 CNPP09543 421 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 CTSSP25774 331 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 RPS9P46781 194 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 PXNP49023 591 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 CLCN4P51793 760 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 FAM193AP78312 1265 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 IGBP1P78318 339 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 NTHL1P78549 312 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 FAM189BP81408 668 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 CDK17Q00537 523 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 TFAP4Q01664 338 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 SP4Q02446 784 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 KRT17Q04695 432 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 CCDC96Q2M329 555 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 SBK1Q52WX2 424 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 CLLU1OSQ5K130 101 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 PCSK4Q6UW60 755 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 DOK3Q7L591 496 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 KBTBD6Q86V97 674 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 MARCH9Q86YJ5 346 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 CMIPQ8IY22 773 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 AMOTL1Q8IY63 956 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 SPATA18Q8TC71 538 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 COG1Q8WTW3 980 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 KXD1Q9BQD3 176 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 GPR87Q9BY21 358 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 HEBP1Q9NRV9 189 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 DNAJC28Q9NX36 388 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 CLCA2Q9UQC9 943 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 HDAC5Q9UQL6 1122 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 COL12A1Q99715 3063 aa4.95□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 NOTCH4Q99466 2003 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 NOTCH2Q04721 2471 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 INPPL1O15357 1258 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 SURF6O75683 361 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 EPN2O95208 641 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 ADH4P08319 380 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 CTSAP10619 480 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 KRT10P13645 584 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 MARK3P27448 753 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 CRHR1P34998 444 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 GPR3P46089 330 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 TOR2AQ5JU69 321 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 ARHGEF16Q5VV41 709 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 ABHD15Q6UXT9 468 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 Q6ZRM9 215 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 HTR3DQ70Z44 454 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 KCNK18Q7Z418 384 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 IL17DQ8TAD2 202 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 TSPEARQ8WU66 669 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 EDEM2Q9BV94 578 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 FTHL17Q9BXU8 183 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 CLMPQ9H6B4 373 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 MLXIPQ9HAP2 919 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 LMAN1LQ9HAT1 526 aa4.94□□□□□ -1.62
CNN3-206ENST00000487539 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms