RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 FSBPO95073 299 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 TNFSF15O95150 251 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 SEMA4FO95754 770 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 ITGA2BP08514 1039 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 PDGFRBP09619 1106 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM191BP0C7N4 346 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 SCP2P22307 547 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 COL8A1P27658 744 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 CD38P28907 300 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 TAF10Q12962 218 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 SHBQ15464 509 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 FAM124AQ86V42 546 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM86AQ8N2M4 240 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 GALNT11Q8NCW6 608 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 HPDLQ96IR7 371 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 ACCSQ96QU6 501 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 NCAPGQ9BPX3 1015 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 CCSER2Q9H7U1 834 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 SGK2Q9HBY8 427 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 KCNG1Q9UIX4 513 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 A0A1W2PPC4 97 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 VGLL3A8MV65 326 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 WASH3PC4AMC7 463 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 COCHO43405 550 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 ABL1P00519 1130 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 IRF1P10914 325 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 LIPCP11150 499 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 PYGBP11216 843 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 IDEP14735 1019 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 WARSP23381 471 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 PCSK1P29120 753 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 ACSL1P33121 698 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 HARS2P49590 506 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 PSEN1P49768 467 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 TPM4P67936 248 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 RBP5P82980 135 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 ZBTB16Q05516 673 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 BNIP3Q12983 259 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 CLCA4Q14CN2 919 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 CCDC183Q5T5S1 534 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 LAYNQ6UX15 382 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 BBS7Q8IWZ6 715 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 GPT2Q8TD30 523 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 PLEKHO2Q8TD55 490 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 SPATA17Q96L03 361 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 SMYD3Q9H7B4 428 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 OLFML3Q9NRN5 406 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 INTS13Q9NVM9 706 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 STK17AQ9UEE5 414 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 HMGXB4Q9UGU5 601 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 ACSL6Q9UKU0 697 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 CDH9Q9ULB4 789 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 POLQO75417 2590 aa8.24□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 SYCE3A1L190 88 aa8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 MTSS1O43312 755 aa8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 ALPPL2P10696 532 aa8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 CKMT1AP12532 417 aa8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 GAP43P17677 238 aa8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 GARTP22102 1010 aa8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 ANXA13P27216 316 aa8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 SLC6A4P31645 630 aa8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 LHX1P48742 406 aa8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 DGKGP49619 791 aa8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 CASP4P49662 377 aa8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 CDH8P55286 799 aa8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 POLE2P56282 527 aa8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 NOP14P78316 857 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 KLRB1Q12918 225 aa8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 C4orf50Q6ZRC1 276 aa8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 FAM35AQ86V20 835 aa8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 CACUL1Q86Y37 369 aa8.23□□□□□ -1.09
SZRD1-208ENST00000476423 FAM114A1Q8IWE2 563 aa8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms