RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471724.5

SSR4-207, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene SSR4, Length 443 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-207ENST00000471724 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 PEBP4Q96S96 227 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 EPAS1Q99814 870 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 SIK2Q9H0K1 926 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 RAB6CQ9H0N0 254 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.52□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 WNT16Q9UBV4 365 aa14.52□□□□□ -0.09
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SSR4-207ENST00000471724 PIAS3Q9Y6X2 628 aa14.52□□□□□ -0.09
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SSR4-207ENST00000471724 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 I6L893 689 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
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SSR4-207ENST00000471724 CTHP32929 405 aa14.51□□□□□ -0.09
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SSR4-207ENST00000471724 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 DDI1Q8WTU0 396 aa14.51□□□□□ -0.09
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SSR4-207ENST00000471724 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
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SSR4-207ENST00000471724 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
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SSR4-207ENST00000471724 OR12D3Q9UGF7 316 aa14.51□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 SALL4Q9UJQ4 1053 aa14.51□□□□□ -0.09
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SSR4-207ENST00000471724 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa14.5□□□□□ -0.09
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SSR4-207ENST00000471724 LRRC38Q5VT99 294 aa14.5□□□□□ -0.09
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SSR4-207ENST00000471724 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 RHOT1Q8IXI2 618 aa14.5□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa14.5□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.5□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.5□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 SLC2A11Q9BYW1 496 aa14.5□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 KCNH6Q9H252 994 aa14.5□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 RETREG1Q9H6L5 497 aa14.5□□□□□ -0.09
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SSR4-207ENST00000471724 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.5□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa14.5□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
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SSR4-207ENST00000471724 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 DUSP10Q9Y6W6 482 aa14.5□□□□□ -0.09
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SSR4-207ENST00000471724 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
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SSR4-207ENST00000471724 C5orf22Q49AR2 442 aa14.49□□□□□ -0.09
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SSR4-207ENST00000471724 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.49□□□□□ -0.09
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SSR4-207ENST00000471724 KIAA1524Q8TCG1 905 aa14.49□□□□□ -0.09
SSR4-207ENST00000471724 HSPH1Q92598 858 aa14.49□□□□□ -0.09
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