RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLK1-208	ENST00000464454	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLK1-208	ENST00000464454	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CLK1-208	ENST00000464454	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454		E7EVH7	732 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	CDK4	P11802	303 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	KEL	P23276	732 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	MPG	P29372	298 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	THBS4	P35443	961 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	MECR	Q9BV79	373 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	NCAM2	O15394	837 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	NKX2-8	O15522	239 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SH3BP5	O60239	455 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	KRT38	O76015	456 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TK1	P04183	234 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	PYGL	P06737	847 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	PRR35	P0CG20	571 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ALAD	P13716	330 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SLC8A1	P32418	973 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	MCM2	P49736	904 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	HSF1	Q00613	529 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	AAK1	Q2M2I8	961 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	CUL5	Q93034	780 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454		M0QZQ0	153 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	CKMT1A	P12532	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	RXRA	P19793	462 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	NDUFS1	P28331	727 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	HOXD12	P35452	270 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ABCG1	P45844	678 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	GHRHR	Q02643	423 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	UEVLD	Q8IX04	471 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	P2RY11	Q96G91	374 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	COG8	Q96MW5	612 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	PDP2	Q9P2J9	529 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	DERA	Q9Y315	318 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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