RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463006.5

CNOT10-208, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, human

TSL 3

Gene CNOT10, Length 692 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT10-208	ENST00000463006	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	INTS13	Q9NVM9	706 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	DCLK1	O15075	740 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	YY2	O15391	372 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	MPPED1	O15442	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	SEPT4	O43236	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	LARGE1	O95461	756 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	C1R	P00736	705 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	MAPK4	P31152	587 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	GGT5	P36269	586 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	LOXL3	P58215	753 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	LILRA4	P59901	499 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	MC1R	Q01726	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CREB5	Q02930	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	PIGF	Q07326	219 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CDC16	Q13042	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	TRABD2A	Q86V40	505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	NFKBID	Q8NI38	313 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	SMO	Q99835	787 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006		H7C0S8	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	PEX12	O00623	359 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	TSPAN4	O14817	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	PROP1	O75360	226 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CER1	O95813	267 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ELFN1	P0C7U0	828 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	IL11	P20809	199 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	PRKAG1	P54619	331 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	SNX16	P57768	344 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	NLRP5	P59047	1200 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF844	Q08AG5	666 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CAMK1	Q14012	370 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	RASA2	Q15283	850 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	NFIL3	Q16649	462 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	HECTD3	Q5T447	861 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	SNX32	Q86XE0	403 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	METTL6	Q8TCB7	284 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	YME1L1	Q96TA2	773 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	BRF2	Q9HAW0	419 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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