RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439517.1

CASC2-204, Transcript of cancer susceptibility 2, humanhuman

TSL 5

Gene CASC2, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2-204ENST00000439517 HMX3A6NHT5 357 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 AREL1O15033 823 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 IRAK2O43187 625 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 ASNA1O43681 348 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 PPFIA2O75334 1257 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 CHEK2O96017 543 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 FAM200BP0CF97 657 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 GYS1P13807 737 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 BTF3P20290 206 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 GATA3P23771 443 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 YY1P25490 414 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 SERPINF1P36955 418 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 RIPK4P57078 832 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 FPGSQ05932 587 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 KCNAB1Q14722 419 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 PLA1AQ53H76 456 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 CACHD1Q5VU97 1274 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 ADGRG3Q86Y34 549 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 GALNT15Q8N3T1 639 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 POC1BQ8TC44 478 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 ACTRT2Q8TDY3 377 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 RSPH1Q8WYR4 309 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 SNX27Q96L92 541 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 TRIB1Q96RU8 372 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 PCDHAC1Q9H158 963 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 TM7SF3Q9NS93 570 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 ZSCAN32Q9NX65 697 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 ETAA1Q9NY74 926 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 MIS18AQ9NYP9 233 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 GJD2Q9UKL4 321 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 ACAD8Q9UKU7 415 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 INSL6Q9Y581 213 aa4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 A0A087WZ62 844 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 CLCA1A8K7I4 914 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 SYT5O00445 386 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 FCHO1O14526 889 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 MGST3O14880 152 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 NCAM2O15394 837 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 KCNQ3O43525 872 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 PEX1O43933 1283 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 A1BGP04217 495 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 POLBP06746 335 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 IDEP14735 1019 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 TPH1P17752 444 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 CAPN3P20807 821 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 FBLP22087 321 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 ACVR2AP27037 513 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 GABRB3P28472 473 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 FOLR3P41439 243 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 RARRES1P49788 294 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 ZBED6P86452 979 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 KRT17Q04695 432 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 PTK2BQ14289 1009 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 STRIP1Q5VSL9 837 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 FAM160B1Q5W0V3 765 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 RAP1GAP2Q684P5 730 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 ZNF790Q6PG37 636 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 CASC1Q6TDU7 716 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 CYP26C1Q6V0L0 522 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 MICALCLQ6ZW33 695 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 SMIM5Q71RC9 77 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 TTC5Q8N0Z6 440 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 VGLL2Q8N8G2 317 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 FAM71BQ8TC56 605 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 LPIN2Q92539 896 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 NELL1Q92832 810 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 RILPL2Q969X0 211 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 SLC46A1Q96NT5 459 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 NELL2Q99435 816 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 SMOQ99835 787 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 CNPPD1Q9BV87 410 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 EPS8L2Q9H6S3 715 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 PDP2Q9P2J9 529 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 LRIT1Q9P2V4 623 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 HEG1Q9ULI3 1381 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 TIAM2Q8IVF5 1701 aa4.75□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 PSME4Q14997 1843 aa4.74□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa4.74□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CASC2-204ENST00000439517 TOR1BO14657 336 aa4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms