RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 RTKNQ9BST9 563 aa15.35■□□□□ 0.05
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TOP3B-206ENST00000436282 UBAP1Q9NZ09 502 aa15.35■□□□□ 0.05
TOP3B-206ENST00000436282 LZTS1Q9Y250 596 aa15.35■□□□□ 0.05
TOP3B-206ENST00000436282 TPP1O14773 563 aa15.34■□□□□ 0.05
TOP3B-206ENST00000436282 IL4RP24394 825 aa15.34■□□□□ 0.05
TOP3B-206ENST00000436282 EDNRBP24530 442 aa15.34■□□□□ 0.05
TOP3B-206ENST00000436282 IGBP1P78318 339 aa15.34■□□□□ 0.05
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TOP3B-206ENST00000436282 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa15.34■□□□□ 0.05
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TOP3B-206ENST00000436282 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa15.34■□□□□ 0.05
TOP3B-206ENST00000436282 MICAL2O94851 1124 aa15.34■□□□□ 0.05
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TOP3B-206ENST00000436282 EEF1DP3Q658K8 133 aa15.34■□□□□ 0.05
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TOP3B-206ENST00000436282 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
TOP3B-206ENST00000436282 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
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TOP3B-206ENST00000436282 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa15.34■□□□□ 0.05
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TOP3B-206ENST00000436282 KLF10Q13118 480 aa15.33■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PACS1Q6VY07 963 aa15.33■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM192Q8IY95 271 aa15.33■□□□□ 0.04
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TOP3B-206ENST00000436282 PCDH19Q8TAB3 1148 aa15.33■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 FAM167AQ96KS9 214 aa15.33■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa15.33■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 LCTP09848 1927 aa15.33■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 M0QYV0 167 aa15.33■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 GCATO75600 419 aa15.33■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PRKCGP05129 697 aa15.33■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 RALBP11234 206 aa15.33■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ADORA2AP29274 412 aa15.33■□□□□ 0.04
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TOP3B-206ENST00000436282 CDO1Q16878 200 aa15.33■□□□□ 0.04
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TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa15.33■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PCDH18Q9HCL0 1135 aa15.33■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 COPG2Q9UBF2 871 aa15.33■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 AP4B1Q9Y6B7 739 aa15.33■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ZBTB14O43829 449 aa15.32■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC166P0CW27 439 aa15.32■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 GPD2P43304 727 aa15.32■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 BOLA3Q53S33 107 aa15.32■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF667Q5HYK9 610 aa15.32■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ATF7IP2Q5U623 682 aa15.32■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 DPH6Q7L8W6 267 aa15.32■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 UNC5BQ8IZJ1 945 aa15.32■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 CDKL2Q92772 493 aa15.32■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 LRGUKQ96M69 825 aa15.32■□□□□ 0.04
TOP3B-206ENST00000436282 GRIP2Q9C0E4 1043 aa15.32■□□□□ 0.04
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