RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414963.2

SF3B1-204, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B1, Length 651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1-204ENST00000414963 NEU3Q9UQ49 428 aa14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 DOCK6Q96HP0 2047 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 KRT10P13645 584 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 GOT1P17174 413 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 LONRF2Q1L5Z9 754 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 CCDC181Q5TID7 509 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 SLC9A4Q6AI14 798 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 C14orf80Q86SX3 495 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 PQLC3Q8N755 202 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 SMARCD2Q92925 531 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 ASB16Q96NS5 453 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 ARHGEF4Q9NR80 690 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 OBP2AQ9NY56 170 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 CDH22Q9UJ99 828 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 CCL26Q9Y258 94 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 SNX10Q9Y5X0 201 aa14.72□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 WASH4PA8MWX3 477 aa14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 E9PAM4 449 aa14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 CREB3O43889 395 aa14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 PRAMEF12O95522 483 aa14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 IRF1P10914 325 aa14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 TACR2P21452 398 aa14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 TPI1P60174 286 aa14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 ADCY2Q08462 1091 aa14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 USP4Q13107 963 aa14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 ZNF77Q15935 545 aa14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 FAM78AQ5JUQ0 283 aa14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 RAP1GAP2Q684P5 730 aa14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 FBXL22Q6P050 247 aa14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 LRRC31Q6UY01 552 aa14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 CPXM2Q8N436 756 aa14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 MNS1Q8NEH6 495 aa14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 STIM2Q9P246 746 aa14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa14.71□□□□□ -0.05
SF3B1-204ENST00000414963 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 F5H5T6 163 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 DCLK1O15075 740 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 CST8O60676 142 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 FOSL2P15408 326 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 RHOQP17081 205 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 ERCC2P18074 760 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 AMPD1P23109 780 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 EPHB2P29323 1055 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 SLC6A4P31645 630 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 KAZNQ674X7 775 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 CHSY1Q86X52 802 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 RFX6Q8HWS3 928 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 PLD5Q8N7P1 536 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 CEP112Q8N8E3 955 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 TTC13Q8NBP0 860 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 RIN3Q8TB24 985 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 E2F7Q96AV8 911 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 OTUB2Q96DC9 234 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 MYADMQ96S97 322 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 POMKQ9H5K3 350 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 HOMER3Q9NSC5 361 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 DONSONQ9NYP3 566 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 VANGL2Q9ULK5 521 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 C2orf16Q68DN1 1984 aa14.7□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa14.69□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 KRIT1O00522 736 aa14.69□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 APOL1O14791 398 aa14.69□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 DAPK3O43293 454 aa14.69□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 APOC2P02655 101 aa14.69□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 LAMP2P13473 410 aa14.69□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 TGM2P21980 687 aa14.69□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 FCARP24071 287 aa14.69□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 CHKAP35790 457 aa14.69□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 NR2C2P49116 596 aa14.69□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 LLGL1Q15334 1064 aa14.69□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 CYP1B1Q16678 543 aa14.69□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 RABGAP1LQ5R372 815 aa14.69□□□□□ -0.06
SF3B1-204ENST00000414963 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms