RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PKDCCQ504Y2 493 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EOGTQ5NDL2 527 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DBX2Q6ZNG2 339 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM150AQ86TG1 271 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMPRSS12Q86WS5 348 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC20A1Q8WUM9 679 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TTC9Q92623 222 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ERLEC1Q96DZ1 483 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM84AQ96KN4 292 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PACSIN1Q9BY11 444 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IMPG2Q9BZV3 1241 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MTMR12Q9C0I1 747 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CYP8B1Q9UNU6 501 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RTN2O75298 545 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 F11P03951 625 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM191BP0C7N4 346 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GABRG2P18507 467 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATF6P18850 670 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MATKP42679 507 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCR10P46092 362 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PDE6CP51160 858 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GALCP54803 685 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MYL6P60660 151 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TUBB4BP68371 445 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BNC1Q01954 994 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VEPH1Q14D04 833 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HLA-BQ31612 363 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SYCP2LQ5T4T6 812 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPOPLQ6IQ16 392 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ALKAL1Q6UXT8 129 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLFN11Q7Z7L1 901 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC47A2Q86VL8 602 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C1orf127Q8N9H9 656 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RFFLQ8WZ73 363 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM176AQ96HP8 235 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PCDHB18PQ96TA0 734 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LGMNQ99538 433 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NIF3L1Q9GZT8 377 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CD93Q9NPY3 652 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC38A7Q9NVC3 462 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GMIPQ9P107 970 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SIX4Q9UIU6 781 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SAR1BQ9Y6B6 198 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RELNP78509 3460 aa9.98□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EFCAB8A8MWE9 144 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TADA3O75528 432 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MTA2O94776 668 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OAZ2O95190 189 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CER1O95813 267 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NFICP08651 508 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF883P0CG24 379 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MYF5P13349 255 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPL9P32969 192 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC6A11P48066 632 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NFATC3Q12968 1075 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRPC3Q13507 836 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM132DQ14C87 1099 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RTP5Q14D33 572 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZBTB6Q15916 424 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GAB4Q2WGN9 574 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MGAT5BQ3V5L5 792 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 XKR4Q5GH76 650 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 JADE1Q6IE81 842 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRIM72Q6ZMU5 477 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CEP112Q8N8E3 955 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRRC57Q8N9N7 239 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 STKLD1Q8NE28 680 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CYP2S1Q96SQ9 504 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CARD6Q9BX69 1037 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM117AQ9C073 453 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TAS2R14Q9NYV8 317 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZMYM5Q9UJ78 669 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ITGA11Q9UKX5 1188 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SNX12Q9UMY4 172 aa9.97□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FLNCQ14315 2725 aa9.96□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A1B0GTW7 788 aa9.96□□□□□ -0.82
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GRID2IPA4D2P6 1211 aa9.96□□□□□ -0.82
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR6C75A6NL08 312 aa9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms