RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 FAM92AA1XBS5 289 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 RASA4O43374 803 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CTSAP10619 480 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ATF2P15336 505 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 YWHAQP27348 245 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CHRNA3P32297 505 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CTNNB1P35222 781 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 BMPR1AP36894 532 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TTC27Q6P3X3 843 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TAC4Q86UU9 113 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MON1AQ86VX9 555 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 FAM131BQ86XD5 332 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 RFX6Q8HWS3 928 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 C7orf57Q8NEG2 295 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 FAM71BQ8TC56 605 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 RUBCNQ92622 972 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 DCLK3Q9C098 648 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 LRRC19Q9H756 370 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 NMUR1Q9HB89 426 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 OSER1Q9NX31 292 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 GMIPQ9P107 970 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 LINC01553A4QN01 128 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 KDM1AO60341 852 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CDC25CP30307 473 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 L1CAMP32004 1257 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 COILP38432 576 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MMRN1Q13201 1228 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MTMR3Q13615 1198 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 C9orf50Q5SZB4 431 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MAP7D3Q8IWC1 876 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PLPP6Q8IY26 295 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 FBXO32Q969P5 355 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 RUNDC3BQ96NL0 473 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CALN1Q9BXU9 219 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 FANCFQ9NPI8 374 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 DDIT4Q9NX09 232 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 AMACRQ9UHK6 382 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 LZTS1Q9Y250 596 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CARD8Q9Y2G2 431 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 F9P00740 461 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 IGLV3-25P01717 112 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 GBP1P32455 592 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 AIF1P55008 147 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 DR1Q01658 176 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 FAPQ12884 760 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 DPYSL2Q16555 572 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 WDR93Q6P2C0 686 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SLC30A9Q6PML9 568 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 VSIG1Q86XK7 387 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ATG4AQ8WYN0 398 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MAGEB5Q9BZ81 275 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ABCG4Q9H172 646 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 HOMER3Q9NSC5 361 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 STIM2Q9P246 746 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PCYOX1Q9UHG3 505 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 FBXW11Q9UKB1 542 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 RAB21Q9UL25 225 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ZNF487B1APH4 448 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 NDUFAB1O14561 156 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TEX28O15482 410 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TTI1O43156 1089 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ATP8B1O43520 1251 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 KATNA1O75449 491 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CXCL14O95715 111 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MYOGP15173 224 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PTGIRP43119 386 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 FNTAP49354 379 aa6.25□□□□□ -1.41
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