RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 CASC4Q6P4E1 433 aa23.18■■□□□ 1.3
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HOXD1-201ENST00000331462 LGMNQ99538 433 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 SLC17A6Q9P2U8 582 aa23.18■■□□□ 1.3
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HOXD1-201ENST00000331462 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
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HOXD1-201ENST00000331462 SLC27A1Q6PCB7 646 aa23.16■■□□□ 1.3
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HOXD1-201ENST00000331462 COPAP53621 1224 aa23.15■■□□□ 1.3
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HOXD1-201ENST00000331462 MX2P20592 715 aa23.14■■□□□ 1.3
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HOXD1-201ENST00000331462 CCDC153Q494R4 210 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 GRTP1Q5TC63 336 aa23.14■■□□□ 1.3
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HOXD1-201ENST00000331462 RNF139Q8WU17 664 aa23.14■■□□□ 1.3
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HOXD1-201ENST00000331462 CERS2Q96G23 380 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXD1-201ENST00000331462 ECSITQ9BQ95 431 aa23.14■■□□□ 1.3
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HOXD1-201ENST00000331462 DEUP1Q05D60 604 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 IZUMO2Q6UXV1 221 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 ATG14Q6ZNE5 492 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 FAM131BQ86XD5 332 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 DNAI2Q9GZS0 605 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 S100A14Q9HCY8 104 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD1-201ENST00000331462 PDP2Q9P2J9 529 aa23.14■■□□□ 1.29
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