RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 PSMB9P28065 219 aa17■□□□□ 0.31
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PACS1-201ENST00000320580 EML3Q32P44 896 aa17■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 PAGE2BQ5JRK9 111 aa17■□□□□ 0.31
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PACS1-201ENST00000320580 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
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PACS1-201ENST00000320580 OFCC1Q8IZS5 231 aa16.99■□□□□ 0.31
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PACS1-201ENST00000320580 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
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PACS1-201ENST00000320580 BMT2Q1RMZ1 405 aa16.98■□□□□ 0.31
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PACS1-201ENST00000320580 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
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PACS1-201ENST00000320580 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 NADKO95544 446 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 UGT2A3Q6UWM9 527 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 SLCO6A1Q86UG4 719 aa16.98■□□□□ 0.31
PACS1-201ENST00000320580 ADAM32Q8TC27 787 aa16.98■□□□□ 0.31
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