RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298466.9

SOHLH1-201, Transcript of spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOHLH1, Length 1,987 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1-201ENST00000298466 GJC1P36383 396 aa22.97■■□□□ 1.27
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC44A4Q53GD3 710 aa22.97■■□□□ 1.27
SOHLH1-201ENST00000298466 ERMARDQ5T6L9 678 aa22.97■■□□□ 1.27
SOHLH1-201ENST00000298466 DAAM2Q86T65 1068 aa22.97■■□□□ 1.27
SOHLH1-201ENST00000298466 C12orf40Q86WS4 652 aa22.97■■□□□ 1.27
SOHLH1-201ENST00000298466 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.97■■□□□ 1.27
SOHLH1-201ENST00000298466 TRPV5Q9NQA5 729 aa22.97■■□□□ 1.27
SOHLH1-201ENST00000298466 STIM2Q9P246 746 aa22.97■■□□□ 1.27
SOHLH1-201ENST00000298466 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.97■■□□□ 1.27
SOHLH1-201ENST00000298466 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa22.97■■□□□ 1.27
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SOHLH1-201ENST00000298466 PFKPQ01813 784 aa22.96■■□□□ 1.27
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SOHLH1-201ENST00000298466 C1orf74Q96LT6 269 aa22.96■■□□□ 1.27
SOHLH1-201ENST00000298466 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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SOHLH1-201ENST00000298466 AP4E1Q9UPM8 1137 aa22.96■■□□□ 1.27
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SOHLH1-201ENST00000298466 F5H5T6 163 aa22.96■■□□□ 1.27
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SOHLH1-201ENST00000298466 KRT86O43790 486 aa22.96■■□□□ 1.27
SOHLH1-201ENST00000298466 RARAP10276 462 aa22.96■■□□□ 1.27
SOHLH1-201ENST00000298466 MAN1A1P33908 653 aa22.96■■□□□ 1.27
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SOHLH1-201ENST00000298466 EFHC2Q5JST6 749 aa22.96■■□□□ 1.27
SOHLH1-201ENST00000298466 TXNDC11Q6PKC3 985 aa22.96■■□□□ 1.27
SOHLH1-201ENST00000298466 ZNF683Q8IZ20 524 aa22.96■■□□□ 1.27
SOHLH1-201ENST00000298466 DNASE1L2Q92874 299 aa22.96■■□□□ 1.27
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SOHLH1-201ENST00000298466 TMEM51Q9NW97 253 aa22.96■■□□□ 1.27
SOHLH1-201ENST00000298466 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.96■■□□□ 1.27
SOHLH1-201ENST00000298466 GRID2IPA4D2P6 1211 aa22.95■■□□□ 1.26
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SOHLH1-201ENST00000298466 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.95■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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SOHLH1-201ENST00000298466 FBXL21Q9UKT6 434 aa22.95■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 KRBA1A5PL33 1030 aa22.94■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 E9PAM4 449 aa22.94■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC6A11P48066 632 aa22.94■■□□□ 1.26
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SOHLH1-201ENST00000298466 NR1H3Q13133 447 aa22.94■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 MPPE1Q53F39 396 aa22.94■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 LRRC57Q8N9N7 239 aa22.94■■□□□ 1.26
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SOHLH1-201ENST00000298466 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
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SOHLH1-201ENST00000298466 CNTN5O94779 1100 aa22.94■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 LRIG2O94898 1065 aa22.94■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 PENKP01210 267 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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SOHLH1-201ENST00000298466 MTA1Q13330 715 aa22.94■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 BOLA3Q53S33 107 aa22.94■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.94■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.94■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 MARK1Q9P0L2 795 aa22.94■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.93■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 CTHP32929 405 aa22.93■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 AIF1P55008 147 aa22.93■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 HADHQ16836 314 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
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SOHLH1-201ENST00000298466 C11orf63Q6NUN7 778 aa22.93■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 SIX5Q8N196 739 aa22.93■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.93■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 WFDC5Q8TCV5 224 aa22.93■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 L1CAMP32004 1257 aa22.92■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 OPRD1P41143 372 aa22.92■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 SLC1A1P43005 524 aa22.92■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 NUMBP49757 651 aa22.92■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.92■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 TPRG1Q6ZUI0 275 aa22.92■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 ARHGEF3Q9NR81 526 aa22.92■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 WNT16Q9UBV4 365 aa22.92■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 NEU3Q9UQ49 428 aa22.92■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 DCXO43602 365 aa22.92■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 CD48P09326 243 aa22.92■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 SEMA3BQ13214 749 aa22.92■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 MANEALQ5VSG8 457 aa22.92■■□□□ 1.26
SOHLH1-201ENST00000298466 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
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