RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298316.6

ARF6-201, Transcript of ADP ribosylation factor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARF6, Length 3,865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6-201ENST00000298316 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 VEPH1Q14D04 833 aa16.09■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 LRRC36Q1X8D7 754 aa16.09■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 TMCO4Q5TGY1 634 aa16.09■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 OSTM1Q86WC4 334 aa16.09■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa16.09■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 E2F7Q96AV8 911 aa16.09■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa16.09■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 TMEM88BA6NKF7 163 aa16.09■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 TMEM63AO94886 807 aa16.09■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 TMEM154Q6P9G4 183 aa16.09■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 CD101Q93033 1021 aa16.09■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 ERLEC1Q96DZ1 483 aa16.09■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 P2RY11Q96G91 374 aa16.09■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 RMDN2Q96LZ7 410 aa16.09■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 SGIP1Q9BQI5 828 aa16.09■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 COLEC11Q9BWP8 271 aa16.09■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 SEPT4O43236 478 aa16.08■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 FBXO21O94952 628 aa16.08■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 ATXN8OSP0DMR3 200 aa16.08■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 SP100P23497 879 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 SOX11P35716 441 aa16.08■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 ACAP1Q15027 740 aa16.08■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 TAS2R42Q7RTR8 314 aa16.08■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 SCLYQ96I15 445 aa16.08■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 PEBP4Q96S96 227 aa16.08■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 CYP4F12Q9HCS2 524 aa16.08■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 HEY2Q9UBP5 337 aa16.08■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 MORF4L1Q9UBU8 362 aa16.08■□□□□ 0.17
ARF6-201ENST00000298316 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa16.08■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 SPATA31D3P0C874 917 aa16.08■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 RPL17P18621 184 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 PURAQ00577 322 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 OLIG2Q13516 323 aa16.08■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 ANO4Q32M45 955 aa16.08■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa16.08■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 RASAL3Q86YV0 1011 aa16.08■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 SYT11Q9BT88 431 aa16.08■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 PAMP19021 973 aa16.08■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 ZNF280DQ6N043 979 aa16.08■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 TRIM67Q6ZTA4 783 aa16.08■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa16.08■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 ARHGAP24Q8N264 748 aa16.08■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 EXOC2Q96KP1 924 aa16.08■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 FGD4Q96M96 766 aa16.08■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 PFDN4Q9NQP4 134 aa16.08■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 WNK3Q9BYP7 1800 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 CA12O43570 354 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 VAPBO95292 243 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 NOMO1Q15155 1222 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 NOMO2Q5JPE7 1267 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 DBF4BQ8NFT6 615 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 TRIB2Q92519 343 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 FAM161BQ96MY7 647 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 MECRQ9BV79 373 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 DNM1LO00429 736 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 NFKB1P19838 968 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 TBX4P57082 545 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 KCNJ2P63252 427 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 RAP1GAP2Q684P5 730 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 AGAP11Q8TF27 550 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 SEPT8Q92599 483 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 ADRA1BP35368 520 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 HDAC4P56524 1084 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 GSDMBQ8TAX9 411 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 MCRS1Q96EZ8 462 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 KLHL5Q96PQ7 755 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 TMEM237Q96Q45 408 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 TTC1Q99614 292 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 SLC17A6Q9P2U8 582 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 SBF2Q86WG5 1849 aa16.07■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 C9IYK1 514 aa16.06■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 CBX4O00257 560 aa16.06■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 CKMP06732 381 aa16.06■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 TKTP29401 623 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 SPRP35270 261 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 FDFT1P37268 417 aa16.06■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 GJA9P57773 515 aa16.06■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 DUSP4Q13115 394 aa16.06■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 TUSC3Q13454 348 aa16.06■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 CST9Q5W186 159 aa16.06■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 SAPCD2Q86UD0 394 aa16.06■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
ARF6-201ENST00000298316 BCO2Q9BYV7 579 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms