RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283875.5

GTF2E1-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E1, Length 3,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-201ENST00000283875 MCM7P33993 719 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ERFP50548 548 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 GNA12Q03113 381 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 RAD51Q06609 339 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 CDK10Q15131 360 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 CRY2Q49AN0 593 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 GALNT18Q6P9A2 607 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 HERC6Q8IVU3 1022 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ADGRG5Q8IZF4 528 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 CLIP4Q8N3C7 705 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 GRPEL2Q8TAA5 225 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ANKRD49Q8WVL7 239 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 WRNIP1Q96S55 665 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 COQ7Q99807 217 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 WNT8AQ9H1J5 351 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 SIX2Q9NPC8 291 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 NPAP1Q9NZP6 1156 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 PCDHA6Q9UN73 950 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 SLX4Q8IY92 1834 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 CCRL2O00421 344 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 VWA5AO00534 786 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 GARTP22102 1010 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ADSSP30520 456 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 PTGS2P35354 604 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 STAT3P40763 770 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 MAGEA4P43358 317 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 PPP4CP60510 307 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC25A3Q00325 362 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ARID5AQ03989 594 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 IKQ13123 557 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 SEL1L2Q5TEA6 688 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ISLR2Q6UXK2 745 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 TMC5Q6UXY8 1006 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 DNAAF5Q86Y56 855 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 FAM109AQ8N4B1 249 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 TCP10LQ8TDR4 215 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 DLG3Q92796 817 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 TSG101Q99816 390 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 LPIN3Q9BQK8 851 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 PCDH12Q9NPG4 1184 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 DCAF16Q9NXF7 216 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 KLQ9UEF7 1012 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ASIC3Q9UHC3 531 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 MAFFQ9ULX9 164 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 POLHQ9Y253 713 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 SCN7AQ01118 1682 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ANKRD62A6NC57 917 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 C2orf71A6NGG8 1288 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 LRRIQ4A6NIV6 560 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 PP2D1A8MPX8 630 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 TCP10L2B9ZVM9 353 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 SPAG6O75602 509 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 KRT5P13647 590 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 GRK2P25098 689 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 HADHAP40939 763 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC18A2Q05940 514 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 RALGDSQ12967 914 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 GNA13Q14344 377 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 RAB39AQ14964 217 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 DGKHQ86XP1 1220 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 KIAA2013Q8IYS2 634 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 TTLQ8NG68 377 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 GSDMBQ8TAX9 411 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 CEP95Q96GE4 821 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 APOPT1Q96IL0 206 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 DPEP3Q9H4B8 488 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ANAPC5Q9UJX4 755 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 HDAC9Q9UKV0 1011 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa7.57□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 YDJCA8MPS7 323 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 TK2O00142 265 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 KRT3P12035 628 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 CDH1P12830 882 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ICAM2P13598 275 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms