RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 GPAMQ9HCL2 828 aa20.79■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 TSPAN16Q9UKR8 245 aa20.79■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 PLLPQ9Y342 182 aa20.79■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 MGEA5O60502 916 aa20.79■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 MYCP01106 439 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 CD4P01730 458 aa20.79■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 ERBB2P04626 1255 aa20.79■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 ZCCHC18P0CG32 403 aa20.79■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 LMO2P25791 158 aa20.79■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 ROR1Q01973 937 aa20.79■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 JOSD2Q8TAC2 188 aa20.79■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 SPATA18Q8TC71 538 aa20.79■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 MTBPQ96DY7 904 aa20.79■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 TTC1Q99614 292 aa20.79■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 MIOSQ9NXC5 875 aa20.79■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 FAM155BO75949 473 aa20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 AQP5P55064 265 aa20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 CUL3Q13618 768 aa20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 CHI3L2Q15782 390 aa20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 LGSNQ5TDP6 509 aa20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 LHX8Q68G74 356 aa20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 CRLF3Q8IUI8 442 aa20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 PNPLA8Q9NP80 782 aa20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 SLC7A8Q9UHI5 535 aa20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 CRABP2P29373 138 aa20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 ERFP50548 548 aa20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 NRLP54845 237 aa20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 CDK18Q07002 472 aa20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 KCNJ11Q14654 390 aa20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 RNF169Q8NCN4 708 aa20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 PCSK1NQ9UHG2 260 aa20.78■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 GPR182O15218 404 aa20.77■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 KITP10721 976 aa20.77■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.77■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 NUDCD3Q8IVD9 361 aa20.77■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 FNIP1Q8TF40 1166 aa20.77■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 FAF2Q96CS3 445 aa20.77■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 RILPQ96NA2 401 aa20.77■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 CALN1Q9BXU9 219 aa20.77■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 TTLL3Q9Y4R7 772 aa20.77■□□□□ 0.92
VGF-201ENST00000249330 STIP1P31948 543 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 RASIP1Q5U651 963 aa20.77■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 EMC1Q8N766 993 aa20.77■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.77■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 HSPH1Q92598 858 aa20.77■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.77■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.77■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 SIRPGQ9P1W8 387 aa20.77■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 ZNF180Q9UJW8 692 aa20.77■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 CHADO15335 359 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 FKBP6O75344 327 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 PFKMP08237 780 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 GSTT1P30711 240 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 LILRA4P59901 499 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 CDC16Q13042 620 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 LPIN1Q14693 890 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 AGMOQ6ZNB7 445 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 CCDC106Q9BWC9 280 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 AVILO75366 819 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 RNF8O76064 485 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 TAF6P49848 677 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 TEX44Q53QW1 395 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 LCLAT1Q6UWP7 414 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 XYLT1Q86Y38 959 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 APBB2Q92870 758 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 CENPKQ9BS16 269 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 SLC13A1Q9BZW2 595 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 CHST12Q9NRB3 414 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 PPM1HQ9ULR3 514 aa20.76■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 XPOTO43592 962 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 USP1O94782 785 aa20.75■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 CCNFP41002 786 aa20.75■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 RGS7P49802 495 aa20.75■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa20.75■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 C1orf21Q9H246 121 aa20.75■□□□□ 0.91
VGF-201ENST00000249330 RSAD1Q9HA92 442 aa20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms