RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 SYPL2Q5VXT5 272 aa17.81■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 CLEC20AQ6ZU45 233 aa17.81■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 RFX8Q6ZV50 586 aa17.81■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 SMC1BQ8NDV3 1235 aa17.81■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 KCNV2Q8TDN2 545 aa17.81■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 SIKE1Q9BRV8 207 aa17.81■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa17.81■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP17.81■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 ARMCX1Q9P291 453 aa17.81■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 GLRA3O75311 464 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 PSMB4P28070 264 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 NDUFV1P49821 464 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 AQP5P55064 265 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 CMPK2Q5EBM0 449 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 MBLAC2Q68D91 279 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 TREML1Q86YW5 311 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 PLCD3Q8N3E9 789 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 TEX9Q8N6V9 391 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 LRRC4Q9HBW1 653 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 PIGVQ9NUD9 493 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 DCDC2Q9UHG0 476 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 RAD54BQ9Y620 910 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 F5H423 210 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 PTGESO14684 152 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 TREHO43280 583 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 FYNP06241 537 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 ADRA1BP35368 520 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 DEUP1Q05D60 604 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 SCAPQ12770 1279 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 TBCCQ15814 346 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 INSCQ1MX18 579 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 TMPRSS6Q8IU80 811 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 CCNYQ8ND76 341 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 NTAN1Q96AB6 310 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 MCUR1Q96AQ8 359 aa17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 CREB3O43889 395 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 PLIN3O60664 434 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 ITGA2BP08514 1039 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 PSEN2P49810 448 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 SEMA3BQ13214 749 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 WSCD1Q658N2 575 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 ATP2A3Q93084 1043 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 SYBUQ9NX95 663 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 SLC17A6Q9P2U8 582 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 SORCS3Q9UPU3 1222 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 PSAT1Q9Y617 370 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 TPP1O14773 563 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 MAGEC1O60732 1142 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 FBXO21O94952 628 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 POLBP06746 335 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 SERPINA6P08185 405 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 HCAR3P49019 387 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 RAP1GDS1P52306 607 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 TAF11Q15544 211 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 ACSBG2Q5FVE4 666 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 KIAA0319Q5VV43 1072 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 HFE2Q6ZVN8 426 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 TLK2Q86UE8 772 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 NME8Q8N427 588 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 NETO2Q8NC67 525 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 RNF169Q8NCN4 708 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 PGBD4Q96DM1 585 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC106Q9BWC9 280 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 CEP41Q9BYV8 373 aa17.79■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 C9IYK1 514 aa17.78■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 H0Y3Z8 333 aa17.78■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 TKTL1P51854 596 aa17.78■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 GJA9P57773 515 aa17.78■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 NME3Q13232 169 aa17.78■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 NAA25Q14CX7 972 aa17.78■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 SPANXN3Q5MJ09 141 aa17.78■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa17.78■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 OLFML2BQ68BL8 750 aa17.78■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa17.78■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 ARHGAP24Q8N264 748 aa17.78■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
CLDN11-201ENST00000064724 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.5 ms