RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054666.10

VAMP3-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP3, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-201ENST00000054666 HGSO14964 777 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 RASSF9O75901 435 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 CABYRO75952 493 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 FYNP06241 537 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 CSH1P0DML2 217 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 CSH2P0DML3 217 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 BDNFP23560 247 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 BRCC3P46736 316 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 HCAR3P49019 387 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 TRIM32Q13049 653 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 NAB1Q13506 487 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 DSC3Q14574 896 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 CYB5D1Q6P9G0 228 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 C4orf50Q6ZRC1 276 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 PID1Q7Z2X4 250 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 CCDC91Q7Z6B0 441 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 RNF180Q86T96 592 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 ECHDC2Q86YB7 292 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF567Q8N184 647 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 MPP5Q8N3R9 675 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 KLHDC9Q8NEP7 349 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF398Q8TD17 642 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 RSPH1Q8WYR4 309 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 EDEM1Q92611 657 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 LRRC37BQ96QE4 947 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 TSSK1BQ9BXA7 367 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 CEP41Q9BYV8 373 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 TKTL2Q9H0I9 626 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 TXNDC16Q9P2K2 825 aa8.5□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 WDR27A2RRH5 827 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 M0QZQ0 153 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 FAM155BO75949 473 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 C1QAP02745 245 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 YY1P25490 414 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 EPHB2P29323 1055 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 CYP2C18P33260 490 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 GRIA1P42261 906 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 NCALDP61601 193 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 COG7P83436 770 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 BNIP1Q12981 228 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 SEMA3BQ13214 749 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 GALNTL6Q49A17 601 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 STEAP4Q687X5 459 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 FAM171BQ6P995 826 aa8.49□□□□□ -1.05
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VAMP3-201ENST00000054666 GLB1LQ6UWU2 654 aa8.49□□□□□ -1.05
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VAMP3-201ENST00000054666 TAC4Q86UU9 113 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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VAMP3-201ENST00000054666 SMC1BQ8NDV3 1235 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 KLHL29Q96CT2 875 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 HDAC11Q96DB2 347 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 ERP27Q96DN0 273 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 RTP3Q9BQQ7 232 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 TRIM55Q9BYV6 548 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 NPHS2Q9NP85 383 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM30AQ9NV96 361 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 MKS1Q9NXB0 559 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 NR2E3Q9Y5X4 410 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 SQORQ9Y6N5 450 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 FAM72CH0Y354 149 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 KCNK1O00180 336 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 ATP5HO75947 161 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 DHRS4L1P0CG22 281 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 TYMPP19971 482 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 MGAT1P26572 445 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 CCNFP41002 786 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 SERPINB4P48594 390 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 CXCR3P49682 368 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 WASHC5Q12768 1159 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 ITGA7Q13683 1181 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 BMPR2Q13873 1038 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 SNCBQ16143 134 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 FAM72AQ5TYM5 149 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 FAM72DQ6L9T8 149 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 CYS1Q717R9 158 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 RASSF3Q86WH2 238 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 FAM72BQ86X60 149 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 NETO2Q8NC67 525 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 URGCPQ8TCY9 931 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 C10orf82Q8WW14 230 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 SUSD3Q96L08 255 aa8.49□□□□□ -1.05
VAMP3-201ENST00000054666 VAT1Q99536 393 aa8.49□□□□□ -1.05
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