RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000076372.4

Sf3b4-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b4, Length 1,915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Drg2Q9QXB9 364 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Map3k6Q9WTR2 1291 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rad9aQ9Z0F6 389 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Umodl1Q5DID3 1319 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Znf106O88466 1888 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Kcng2F7A6P6 480 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Akain1G3UWD5 69 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Atf2P16951 487 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Msx3P70354 204 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vps45P97390 570 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Uba1Q02053 1058 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 StilQ60988 1262 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Znf821Q6PD05 413 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vmn2r26Q6TAC4 855 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fez2Q6TYB5 348 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr1128Q7TR47 311 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Orai2Q8BH10 250 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rps6kc1Q8BLK9 1056 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Slc7a4Q8BLQ7 635 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tspan33Q8R3S2 283 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Slc25a3Q8VEM8 357 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 FdpsQ920E5 353 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tsnaxip1Q99P25 704 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tmem174Q9DCX7 243 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Stau1Q9Z108 487 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Aldoart1A6ZI46 419 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm5795E9PZN8 263 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ca8P28651 291 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Dennd1bQ3U1T9 766 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm29609Q3UU56 907 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rcsd1Q3UZA1 412 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 MlipQ5FW52 269 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Eif2b4Q61749 524 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gtf3c2Q8BL74 907 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fra10ac1Q8BP78 315 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Q8C1R3 189 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Uhrf1Q8VDF2 782 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Lmcd1Q8VEE1 365 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Lrp8Q924X6 996 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cybrd1Q925G2 290 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Scube2Q9JJS0 997 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Grb14Q9JLM9 538 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Klrc2Q9WTJ9 238 aa15.94■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Adamts6D3Z1A5 1117 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Serpina3iD3Z450 408 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Dnajc21E9Q8D0 531 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Zbtb11G5E8B9 1050 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Dpysl2O08553 572 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gdap1O88741 358 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 DcxO88809 366 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Il2P04351 169 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Prf1P10820 554 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gnat1P20612 350 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 ZfaP23607 742 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gpr3P35413 330 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 St3gal1P54751 337 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 AdprhP54923 362 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rpl22P67984 128 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ceacam5Q3UKK2 947 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Znf583Q3V080 568 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Psg28Q4KL66 472 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 MroQ7TNB4 248 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr20Q7TRX9 314 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Shc2Q8BMC3 573 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Nlrp4bQ8C6J9 863 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ulbp1Q8HWA3 334 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Arhgap18Q8K0Q5 663 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Mkl1Q8K4J6 964 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gspt1Q8R050 636 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 AjubaQ91XC0 547 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vangl2Q91ZD4 521 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Lpin1Q91ZP3 924 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 ArpinQ9D0A3 226 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Phf2Q9WTU0 1096 aa15.93■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cyp4f40G3UW81 524 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vmn2r39L7N2E5 861 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rab20P35295 233 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 TubP50586 505 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ccdc114Q3UX62 658 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Itga1Q3V3R4 1179 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ifnl2Q4VK74 193 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ccdc92bQ5SUE3 299 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ptpn14Q62130 1189 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Il17reQ8BH06 637 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Phactr3Q8BYK5 558 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cacnb2Q8CC27 655 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Dennd1aQ8K382 1016 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vmn1r188Q8K3N2 308 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Trim60Q8VI40 466 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rpl34Q9D1R9 117 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tspan17Q9D7W4 270 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Trpc7Q9WVC5 862 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ralgps1A2AR50 585 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm5415E9PXF3 478 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pcdh9F8VPK8 1237 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm7995L7N2E4 160 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Usp2O88623 613 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Folr1P35846 255 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fmo3P97501 534 aa15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Acsbg2Q2XU92 667 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.9 ms