RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pnpt1Q8K1R3 783 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 NelfcdQ922L6 591 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cybrd1Q925G2 290 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kifc1Q9QWT9 674 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm5538W4VSP6 401 aa12.13□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r11E9Q4X4 861 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cd247P24161 164 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 SiaeP70665 541 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp8b1Q148W0 1251 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Enoph1Q8BGB7 257 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pdik1lQ8QZR7 341 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp617Q91WM0 559 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cog2Q921L5 731 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 NbnQ9R207 751 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rpl9-ps6A0A140T8T4 192 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 9230113P08RikD3YWX3 137 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppp1r36D3Z0R2 411 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 TertO70372 1122 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrrc6O88978 473 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01631 113 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Yap1P46938 488 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rpl9P51410 192 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wfs1P56695 890 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plcl1Q3USB7 1096 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Birc2Q62210 612 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr20Q7TRX9 314 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Agap3Q8VHH5 910 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 QpctQ9CYK2 362 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnf186Q9D241 226 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Htra2Q9JIY5 458 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ncf2O70145 525 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Htr2cP34968 459 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Npas2P97460 816 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 AxlQ00993 888 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arnt2Q61324 712 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ltbp3Q61810 1268 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arhgap26Q6ZQ82 814 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnali1Q8BVN8 258 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 HpdlQ8K248 371 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gsto2Q8K2Q2 248 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Caap1Q8VDY9 356 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ddx1Q91VR5 740 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcdha1Q91Y21 948 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ndufb5Q9CQH3 189 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 TsaccQ9DA44 124 aa12.12□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp985A2A7A5 519 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 JrklB2RRL2 523 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adamts6D3Z1A5 1117 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wdr95D3Z7A8 784 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp715G3X9T1 886 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r67K7N6T2 851 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pold2O35654 469 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 LdhcP00342 332 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gabrr2P56476 465 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smpdl3aP70158 445 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 IqcmQ149I8 489 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Acsbg2Q2XU92 667 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfml2bQ3V1G4 746 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 MlipQ5FW52 269 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc6a4Q60857 630 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf821Q6PD05 413 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r26Q6TAC4 855 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pak5Q8C015 719 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Robo4Q8C310 1012 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dennd1aQ8K382 1016 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Marc1Q9CW42 340 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Syde1Q9DBZ9 737 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tlr9Q9EQU3 1032 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cbx8Q9QXV1 362 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rfc2Q9WUK4 349 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nme3Q9WV85 169 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kif26aQ52KG5 1881 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bclaf3A2AG58 752 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcng1A2BDX4 514 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Apobec1P51908 229 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Foxred2Q3USW5 665 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sec23ipQ6NZC7 998 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gbp5Q8CFB4 590 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Acsl5Q8JZR0 683 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 McmbpQ8R3C0 642 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcdha3Q91Y16 942 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fads1Q920L1 447 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 St13Q99L47 371 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wdr83Q9DAJ4 315 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Malrd1A2AJX4 2123 aa12.11□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 March10E9PX79 788 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nudt1P53368 156 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 ItkQ03526 625 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sox13Q04891 613 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cntn3Q07409 1028 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trmt10cQ3UFY8 414 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrrc47Q505F5 581 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fbxo39Q5NBU5 443 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 PterQ60866 349 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 TCAIMQ66JZ4 499 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eif2aQ8BJW6 581 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tspan33Q8R3S2 283 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pdxdc1Q99K01 787 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Armc9Q9D2I5 817 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp6v1e2Q9D593 226 aa12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.2 ms