RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sept8Q8CHH9 429 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ThtpaQ8JZL3 224 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ItpkaQ8R071 459 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Etv3Q8R4Z4 513 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CbsQ91WT9 561 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Marc2Q922Q1 338 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 S100pbpQ9D5K4 396 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 DmgdhQ9DBT9 869 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Wfdc1Q9ESH5 211 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Capn10Q9ESK3 666 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trpc4Q9QUQ5 974 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ehd1Q9WVK4 534 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Magea10A2AMW4 325 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CtcflA2APF3 636 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lrrc63A6H694 637 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 OgdhlE9Q7L0 1029 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 HmbsP22907 361 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PhexP70669 749 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kcnq1P97414 668 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znf800Q0VEE6 662 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cyp2c65Q148B1 490 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znf583Q3V080 568 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam20cQ5MJS3 579 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 LbpQ61805 481 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ugt1a9Q62452 528 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Phtf2Q8CB19 747 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cyp4a12aQ91WL5 508 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 GsdmcQ99NB5 468 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam111aQ9D2L9 613 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Terb2Q9D494 218 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam227bQ9D518 532 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prss23Q9D6X6 382 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gid8Q9D7M1 228 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Borcs5Q9D920 195 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dcaf6Q9DC22 876 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rsc1a1Q9ER99 582 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rnf14Q9JI90 485 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Htra2Q9JIY5 458 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cdc42ep4Q9JM96 349 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 DgkeQ9R1C6 564 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc12a7Q9WVL3 1083 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ttc7bE9Q6P5 843 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 4930544D05RikJ3QK56 214 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Krt10P02535 570 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tgfb3P17125 410 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tulp2P46686 562 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Stx2Q00262 289 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pnpla5Q32LZ8 432 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ppp1r13lQ5I1X5 824 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Als2clQ60I26 952 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gstt1Q64471 240 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tlr13Q6R5N8 991 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr792Q7TRH9 311 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znf423Q80TS5 1292 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cox18Q8VC74 331 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dlg2Q91XM9 852 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Q9CPZ3 230 aa9.18□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lrrc74aA0A1Y7VMD6 494 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm8113E0CXS8 587 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Foxm1O08696 760 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 VcpQ01853 806 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Clhc1Q5M6W3 596 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Map3k10Q66L42 940 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gtf2a2Q80ZM7 109 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Them6Q80ZW2 207 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tbc1d17Q8BYH7 645 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam126bQ8C729 530 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Bbs7Q8K2G4 715 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr1353Q8VGU8 309 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Chn1Q91V57 459 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Catsper1Q91ZR5 686 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rilpl2Q99LE1 197 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Wdr45bQ9CR39 344 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NarfQ9CYQ7 462 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Katnal2Q9D3R6 539 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tlr6Q9EPW9 795 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cse1lQ9ERK4 971 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trim10Q9WUH5 489 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm3371F7CQW8 167 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vmn2r1O70410 912 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fgfr1P16092 822 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PenkP22005 268 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PlaaP27612 794 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Foxk1P42128 719 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cyp2c66Q5GLZ0 490 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sdf4Q61112 361 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sh3rf1Q69ZI1 892 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ano5Q75UR0 904 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znf12Q7TSI0 686 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Arhgef38Q80VK6 770 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmtc4Q8BG19 741 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ppm1lQ8BHN0 360 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ttc4Q8R3H9 386 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Stx18Q8VDS8 334 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr393Q8VGR6 312 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PmpcbQ9CXT8 489 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Adck1Q9D0L4 525 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Adgrf4Q9D2L6 698 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Plpp6Q9D4F2 292 aa9.17□□□□□ -0.94
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem86aQ9D8N3 241 aa9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.9 ms