RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P3h1Q3V1T4 739 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcna4Q61423 654 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krt32Q62168 407 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wscd1Q80XH4 572 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem82Q8R115 356 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nup85Q8R480 656 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Alas1Q8VC19 642 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MtrexQ9CZU3 1040 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dcaf6Q9DC22 876 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Abcb9Q9JJ59 762 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DgkeQ9R1C6 564 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 VarsQ9Z1Q9 1263 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dhtkd1A2ATU0 921 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 D3Z070 196 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adcy1O88444 1118 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pgk2P09041 417 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 LynP25911 512 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nlrc4Q3UP24 1024 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim38Q5SZ99 471 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxw2Q60584 422 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bcar1Q61140 874 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Papd5Q68ED3 633 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Exoc3l4Q6DIA2 721 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc154Q6RUT8 657 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trpv1Q704Y3 839 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prr33Q8C494 260 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TwnkQ8CIW5 685 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ClyblQ8R4N0 338 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adi1Q99JT9 179 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arpc2Q9CVB6 300 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ParvbQ9ES46 365 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PollQ9QXE2 573 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PignQ9R1S3 931 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trpv2Q9WTR1 756 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bscl2Q9Z2E9 383 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr600E9PUN7 314 aa16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kif6E9PX57 802 aa16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr731F8VQB9 326 aa16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Akap1O08715 857 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Impdh2P24547 514 aa16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bop1P97452 732 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mthfd1lQ3V3R1 977 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PoliQ6R3M4 717 aa16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1057Q7TR75 315 aa16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcng4Q80XM3 506 aa16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gstt4Q9D4P7 240 aa16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp2r3cQ9JK24 453 aa16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plod3Q9R0E1 741 aa16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ZxdbA2CE44 873 aa16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1354E9Q5G9 310 aa16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eps8Q08509 821 aa16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cfhr2Q4LDF6 332 aa16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ProcrQ64695 242 aa16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam214aQ69ZK7 1075 aa16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smndc1Q8BGT7 238 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppm1lQ8BHN0 360 aa16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tspan8Q8R3G9 235 aa16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CabyrQ9D424 453 aa16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chit1Q9D7Q1 464 aa16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dclre1aQ9JIC3 1026 aa16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chek2Q9Z265 546 aa16.46■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PotegA5H0M4 473 aa16.46■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NuggcD3YWJ0 796 aa16.46■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Inpp5aE9QAS7 422 aa16.46■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MipP51180 263 aa16.46■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fermt1P59113 677 aa16.46■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Agap2Q3UHD9 1186 aa16.46■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp956Q3UZY6 572 aa16.46■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmprss4Q8VCA5 435 aa16.46■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr356Q8VFP5 315 aa16.46■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdh18Q8VHR0 1134 aa16.46■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ugp2Q91ZJ5 508 aa16.46■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tbc1d15Q9CXF4 671 aa16.46■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Commd8Q9CZG3 183 aa16.46■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cab39lQ9DB16 337 aa16.46■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 F6Y6L6 278 aa16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Parp3Q3ULW8 533 aa16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CttnQ60598 546 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Utp14bQ6EJB6 756 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Psd4Q8BLR5 1005 aa16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Morc4Q8BMD7 928 aa16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ints6lQ8BND4 861 aa16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mospd1Q8VEL0 213 aa16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GarsQ9CZD3 729 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Efhc1Q9D9T8 648 aa16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Neu2Q9JMH3 379 aa16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Itgb1bp2Q9R000 350 aa16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Twf2Q9Z0P5 349 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arhgef26D3YYY8 869 aa16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ces1bD3Z5G7 567 aa16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Icam1P13597 537 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PrkcdP28867 674 aa16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hsd11b2P51661 386 aa16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pdss1Q33DR2 409 aa16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc90bQ8C3X2 256 aa16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 VcpkmtQ8C436 228 aa16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plin3Q9DBG5 437 aa16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PllpQ9DCU2 182 aa16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 StrcQ8VIM6 1809 aa16.45■□□□□ 0.22
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Robo3Q9Z2I4 1366 aa16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.8 ms