RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025393.13

Smad4-201, Transcript of Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Smad4, Length 3,384 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4-201ENSMUST00000025393 Rnf138rt1Q9D9M9 248 aa20.8■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 CrotQ9DC50 612 aa20.8■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Zfp990B1AVN5 605 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Tatdn2B7ZNL9 783 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Vmn2r19G5E8G4 854 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Slc1a6O35544 561 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Prl3b1P09586 222 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ccna2P51943 422 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 YwhaeP62259 255 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 TwnkQ8CIW5 685 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Glis2Q8VDL9 521 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Pcdhb1Q91Y08 818 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Commd8Q9CZG3 183 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Serpinb9bQ9DAV6 377 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Chmp2aQ9DB34 222 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Osbpl8B9EJ86 889 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Lta4hP24527 611 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 NyxP83503 476 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Lsg1Q3UM18 644 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Abi3bpQ59IW6 1179 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Gxylt2Q810K9 444 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 ChfrQ810L3 664 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Cept1Q8BGS7 416 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Klhl38Q8BSF5 581 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ubxn2aQ99KJ0 258 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Nuf2Q99P69 463 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 ProzQ9CQW3 399 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Chit1Q9D7Q1 464 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Cab39lQ9DB16 337 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Limd1Q9QXD8 668 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Top3bQ9Z321 862 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Olfr271-ps1A0A1L1SQH2 283 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Hoxc10P31257 342 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Otud5Q3U2S4 566 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Myo1gQ5SUA5 1024 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 JrkQ60976 557 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Syn2Q64332 586 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Slc39a14Q75N73 489 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 March4Q80TE3 409 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Dyrk4Q8BI55 632 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ptk7Q8BKG3 1062 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Slc35c2Q8VCX2 364 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 MyocdQ8VIM5 935 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Adgrf4Q9D2L6 698 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 MajinQ9D992 256 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ern2Q9Z2E3 911 aa20.79■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Psmc3O88685 442 aa20.78■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Arhgap26Q6ZQ82 814 aa20.78■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Clec4b1Q7TS58 209 aa20.78■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Plin5Q8BVZ1 463 aa20.78■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Trim32Q8CH72 655 aa20.78■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Adcy4Q91WF3 1077 aa20.78■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 1700129C05RikQ9CQ77 218 aa20.78■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Fam136aQ9CR98 138 aa20.78■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 PllpQ9DCU2 182 aa20.78■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Akap8lQ9R0L7 642 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Akap1O08715 857 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Mxi1P50540 228 aa20.78■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Osbp2Q5QNQ6 908 aa20.78■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Cd180Q62192 661 aa20.78■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Tmem82Q8R115 356 aa20.78■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Dbn1Q9QXS6 706 aa20.78■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 SisF8VQM5 1818 aa20.78■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa20.78■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 CercamA3KGW5 592 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Kcng2F7A6P6 480 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Gnao1P18872 354 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Faf1P54731 649 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Cd36Q08857 472 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Mcm9Q2KHI9 1134 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Pld5Q3UNN8 536 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Acot5Q6Q2Z6 421 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Suds3Q8BR65 328 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Tp53bp2Q8CG79 1128 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 UvragQ8K245 698 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Gspt1Q8R050 636 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Nsmce2Q91VT1 247 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Rad51cQ924H5 366 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Micu3Q9CTY5 523 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Syap1Q9D5V6 365 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 MrrfQ9D6S7 262 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Zscan12Q9Z1D7 501 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Kcnq2Q9Z351 759 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Tnfrsf11bO08712 401 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Cd3gP11942 182 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Cbx2P30658 519 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Ptchd3Q0EEE2 906 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Fbxo39Q5NBU5 443 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Jak2Q62120 1129 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Sema4aQ62178 760 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Kansl2Q8BQR4 486 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Trub1Q8C0D0 338 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Adgrg2Q8CJ12 1009 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Mul1Q8VCM5 352 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Olfr1325Q8VF43 315 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 HnrnprQ8VHM5 632 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Stk33Q924X7 491 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Me2Q99KE1 589 aa20.77■□□□□ 0.92
Smad4-201ENSMUST00000025393 Slc12a9Q99MR3 914 aa20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.5 ms