RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Auts2A0A087WPF7 1261 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 A930018M24RikB7ZMY3 218 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Srsf11E9Q6E5 511 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PrphP15331 475 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Apobec1P51908 229 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Foxp2P58463 714 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Neurog1P70660 244 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mcl1P97287 331 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bpifa1P97361 278 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pou6f1Q07916 301 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stt3bQ3TDQ1 823 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cep295nlQ497N6 533 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ADGRF3Q58Y75 991 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5169Q5M8P2 212 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf215Q5SPX3 379 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam46cQ5SSF7 391 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FancbQ5XJY6 703 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pacsin1Q61644 441 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Enox1Q8BHR2 643 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adipor2Q8BQS5 386 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Svs3bQ8BZH8 265 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Apol9bQ8C7I4 310 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ttc23Q8CHY7 488 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hid1Q8R1F6 788 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vps36Q91XD6 386 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HnrnpllQ921F4 591 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sytl2Q99N50 950 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rasgef1cQ9D300 466 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cables1Q9ESJ1 568 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scube2Q9JJS0 997 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnajb8Q9QYI7 227 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Map3k6Q9WTR2 1291 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 LipgQ9WVG5 500 aa11.59□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dmxl2Q8BPN8 3032 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr316A0A0N4SVP2 306 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp626A0A0U1RQ84 676 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 A0A286YCQ6 122 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Myo1eE9Q634 1107 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prdm15E9Q8T2 1174 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp408H7BX78 710 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ring1O35730 406 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bmp6P20722 510 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tbxa2rP30987 341 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tgif1P70284 272 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AxlQ00993 888 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klrb1Q0ZUP1 214 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rmdn3Q3UJU9 470 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ermp1Q3UVK0 898 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr318Q5NCD7 306 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sema3cQ62181 751 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SyncripQ7TMK9 623 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wdtc1Q80ZK9 677 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Anapc5Q8BTZ4 740 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PigtQ8BXQ2 582 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rcor2Q8C796 523 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tspan33Q8R3S2 283 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1233Q8VGN0 305 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prss28Q924N9 274 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Xpo6Q924Z6 1125 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Smtnl1Q99LM3 459 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpa3Q9CQ71 121 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wdr45bQ9CR39 344 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Snx7Q9CY18 387 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bbs5Q9CZQ9 341 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klhl40Q9D783 621 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DynapQ9D7M5 161 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cse1lQ9ERK4 971 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rtn3Q9ES97 964 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Piwil1Q9JMB7 862 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abhd2Q9QXM0 425 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dctpp1Q9QY93 170 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slfn14V9GXG1 899 aa11.58□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igkv5-39A0A0G2JDV4 115 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam81bA0A140LI28 432 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zbtb34A2ATY4 518 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Daw1D3Z7A5 415 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NcapgE9PWG6 1004 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ebf2O08792 575 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dpysl4O35098 572 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stx1aO35526 288 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nthl1O35980 300 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Men1O88559 611 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rb1P13405 921 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2-Q8P14430 326 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HpdP49429 393 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lhx5P61375 402 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rps14P62264 151 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp781Q0P5U5 243 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam8a1Q3URQ4 399 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nxpe4Q52KP5 543 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mef2dQ63943 514 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr156Q6PCP7 798 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfyve28Q6ZPK7 905 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Efr3bQ6ZQ18 817 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp397Q7TNK4 527 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trim62Q80V85 475 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Timm29Q8BGX2 266 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem30bQ8BHG3 353 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 D130040H23RikQ8BII3 405 aa11.57□□□□□ -0.56
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ttc27Q8CD92 847 aa11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.7 ms