RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634499.1

NRXN3-217, Transcript of neurexin 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NRXN3, Length 6,069 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3-217ENST00000634499 PPP1R36Q96LQ0 422 aa11.96□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 PGLYRP2Q96PD5 576 aa11.96□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 TKTL2Q9H0I9 626 aa11.96□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 ELOVL6Q9H5J4 265 aa11.96□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 EFCAB1Q9HAE3 211 aa11.96□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 FMN2Q9NZ56 1722 aa11.96□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 SNTNA6NMZ2 147 aa11.96□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 PGK1P00558 417 aa11.96□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 NECAB2Q7Z6G3 386 aa11.96□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 MCOLN3Q8TDD5 553 aa11.96□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 COPS5Q92905 334 aa11.96□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 CLUHO75153 1309 aa11.96□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 MGAT4DA6NG13 374 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 B2RBV5 119 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 E5RJQ4 531 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 MTA2O94776 668 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 CPA3P15088 417 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 TKTP29401 623 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 MIPP30301 263 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 CTNNB1P35222 781 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 DMC1Q14565 340 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 TRIM69Q86WT6 500 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 SUFUQ9UMX1 484 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 VPS4BO75351 444 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 WLSQ5T9L3 541 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 WSCD1Q658N2 575 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 CCDC3Q9BQI4 270 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 LACRTQ9GZZ8 138 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 FBXL21Q9UKT6 434 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 GLI1P08151 1106 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 CDC25CP30307 473 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 GPC1P35052 558 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 PRKAA1Q13131 559 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 PEX6Q13608 980 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 LONP2Q86WA8 852 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 SCUBE3Q8IX30 993 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 EME1Q96AY2 570 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 SGF29Q96ES7 293 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 MAN1C1Q9NR34 630 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 RNF103O00237 685 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 EPB42P16452 691 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 ICAM3P32942 547 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 CDK7P50613 346 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 WDR59Q6PJI9 974 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 KCNK18Q7Z418 384 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 ARMC7Q9H6L4 198 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 SMPD4Q9NXE4 827 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 VTI1BQ9UEU0 232 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 A0A088AWK7 358 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 O00370 1275 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 KPNA5O15131 536 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 CCDC130P13994 396 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 TSHRP16473 764 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 FLT3LGP49771 235 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 SPPL2BQ8TCT7 592 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 ZFP42Q96MM3 310 aa11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 KNDC1Q76NI1 1749 aa11.94□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 TMEM150BA6NC51 233 aa11.94□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 BTNL10A8MVZ5 291 aa11.94□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 USP17L7P0C7H9 530 aa11.94□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 CDH8P55286 799 aa11.94□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 ITIH4Q14624 930 aa11.94□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 MTSS1LQ765P7 747 aa11.94□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa11.94□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 KCNMB4Q86W47 210 aa11.94□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 ACTR8Q9H981 624 aa11.94□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 MAPRE3Q9UPY8 281 aa11.94□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 CCT8L1PA6NM43 557 aa11.94□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 ITGB5P18084 799 aa11.94□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 TUSC3Q13454 348 aa11.94□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 CYP4Z1Q86W10 505 aa11.94□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 EPS8L1Q8TE68 723 aa11.94□□□□□ -0.5
NRXN3-217ENST00000634499 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms