RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 DESI2Q9BSY9 194 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 SDCBP2Q9H190 292 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 DEF6Q9H4E7 631 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 VRTNQ9H8Y1 702 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 SPHK2Q9NRA0 654 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 GMIPQ9P107 970 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC6A14Q9UN76 642 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 MSRB2Q9Y3D2 182 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 STARD13Q9Y3M8 1113 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 FASNP49327 2511 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-216ENST00000628306 AKR1B10O60218 316 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 TNNT1P13805 278 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF11P52732 1056 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 ETF1P62495 437 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 TNNC1P63316 161 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 DUOXA1Q1HG43 343 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 GJB7Q6PEY0 223 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2I1PQ8NGU4 316 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 SHC3Q92529 594 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 ELMO3Q96BJ8 720 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 ACOX2Q99424 681 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 DEC1Q9P2X7 70 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO1AQ9UBC5 1043 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP8B3O60423 1300 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM221BA6H8Z2 402 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 HLA-DRAP01903 254 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINF2P08697 491 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 CD59P13987 128 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 DPP6P42658 865 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC18A3Q16572 532 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS36Q86VN1 386 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGEF19Q8IW93 802 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM71AQ8IYT1 594 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 PGBD3Q8N328 593 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 TAF4BQ92750 862 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 P2RY11Q96G91 374 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC32A1Q9H598 525 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 CD93Q9NPY3 652 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 TAF4O00268 1085 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 BEST1O76090 585 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 VNN1O95497 513 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 CFIP05156 583 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 WASP42768 502 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 FUKQ8N0W3 1084 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 GJB3O75712 270 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXB2P14652 356 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFV2P19404 249 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 ATICP31939 592 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 VAV2P52735 878 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 PTK2Q05397 1052 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF33AQ06730 810 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 BIRC3Q13489 604 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 ACRBPQ8NEB7 543 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP76Q8TAP6 659 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 SMOQ99835 787 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 TSGA10Q9BZW7 698 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 PRRT4C9JH25 899 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 PJA2O43164 708 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 NTSR1P30989 418 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP25P42331 645 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 RING1Q06587 406 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 NCOA4Q13772 614 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 MINDY1Q8N5J2 469 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 KREMEN1Q96MU8 473 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 SYT11Q9BT88 431 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT86O43790 486 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 CACNG3O60359 315 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 PHACTR2O75167 634 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 TBX18O95935 607 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 ASS1P00966 412 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 IRF1P10914 325 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 PIK3CAP42336 1068 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 ANO4Q32M45 955 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 BTBD8Q5XKL5 378 aa25.21■■□□□ 1.63
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