RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 KNL1Q8NG31 2342 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 TSPAN3O60637 253 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 LATS1O95835 1130 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 BST2Q10589 180 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 KIF19Q2TAC6 998 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 C19orf48Q6RUI8 117 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 CHST9Q7L1S5 443 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 ADIPOR2Q86V24 386 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF366Q8N895 744 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 MDM1Q8TC05 714 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 RHBDD1Q8TEB9 315 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 EEF2KMTQ96G04 330 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 SPATA32Q96LK8 384 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 CDC6Q99741 560 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 FBRSQ9HAH7 460 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC4Q9HBW1 653 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 OSGEPQ9NPF4 335 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 ABCB8Q9NUT2 735 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 TSPAN16Q9UKR8 245 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 PLA2G4CQ9UP65 541 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 ACACAQ13085 2346 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 FASNP49327 2511 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 STX10O60499 249 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 SEMA4FO95754 770 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 DLDP09622 509 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 EPB41P11171 864 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 GRIA4P48058 902 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 SGSHP51688 502 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 KRT85P78386 507 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 ZBTB16Q05516 673 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 ADIGQ0VDE8 80 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 TEAD4Q15561 434 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 PTPRNQ16849 979 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 COL28A1Q2UY09 1125 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 CBWD6Q4V339 395 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 SGO2Q562F6 1265 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 CBWD3Q5JTY5 395 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 CBWD5Q5RIA9 395 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 ADGRF1Q5T601 910 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 BSPRYQ5W0U4 402 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 KRBA2Q6ZNG9 492 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 AHI1Q8N157 1196 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF139Q8WU17 664 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 EDEM1Q92611 657 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 BIRC7Q96CA5 298 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 BTBD1Q9H0C5 482 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 TM9SF3Q9HD45 589 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 PRSS16Q9NQE7 514 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 DKK4Q9UBT3 224 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 HESX1Q9UBX0 185 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 GGA2Q9UJY4 613 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 BTBD3Q9Y2F9 522 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 SNX11Q9Y5W9 270 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 APC2O95996 2303 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 PLXNA2O75051 1894 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 YJEFN3A6XGL0 299 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 E7ENQ6 273 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 CETN3O15182 167 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 MSI1O43347 362 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 PCDHGA12O60330 932 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 DNTTP04053 509 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 CD27P26842 260 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 RPS14P62263 151 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 CUL2Q13617 745 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 MPP7Q5T2T1 576 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 MBLAC2Q68D91 279 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 MSANTD2Q6P1R3 559 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 LAYNQ6UX15 382 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 PDZD3Q86UT5 571 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 SCML4Q8N228 414 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 GALNT15Q8N3T1 639 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 WFDC5Q8TCV5 224 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 KCTD13Q8WZ19 329 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 GOLGA1Q92805 767 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 IGSF8Q969P0 613 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 ORAI3Q9BRQ5 295 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-226ENST00000593200 SGK2Q9HBY8 427 aa10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms