RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579843.5

TRIM16-218, Transcript of tripartite motif containing 16, humanhuman

TSL 4

Gene TRIM16, Length 459 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16-218ENST00000579843 SPATA17Q96L03 361 aa7.24□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 ACBD6Q9BR61 282 aa7.24□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 TTLL2Q9BWV7 592 aa7.24□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 NEUROG2Q9H2A3 272 aa7.24□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 PRSS16Q9NQE7 514 aa7.24□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 KLHL11Q9NVR0 708 aa7.24□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 LOXL2Q9Y4K0 774 aa7.24□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 A0A1W2PP55 124 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 C10orf142B7Z368 130 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 MUSKO15146 869 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 HCRTO43612 131 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 GREM1O60565 184 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 JAK2O60674 1132 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 BDNFP23560 247 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 CD82P27701 267 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 MAGEA11P43364 429 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 TAF6P49848 677 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 ATP1A2P50993 1020 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 MAPK10P53779 464 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 HDAC4P56524 1084 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 STAT4Q14765 748 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 E2F5Q15329 346 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 POM121L1PQ3SYA9 428 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 TMEM215Q68D42 235 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 JADE1Q6IE81 842 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 CCDC13Q8IYE1 715 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 WDR48Q8TAF3 677 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 NKD1Q969G9 470 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 FAM212AQ96EL1 285 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 SLITRK1Q96PX8 696 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 CCDC3Q9BQI4 270 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 SLC29A3Q9BZD2 475 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 SEMA6CQ9H3T2 930 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 RRN3Q9NYV6 651 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 EHD2Q9NZN4 543 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 CA5BQ9Y2D0 317 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 MKRN2OSH3BPM6 223 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 STMND1H3BQB6 276 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 CLGNO14967 610 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 WIPF1O43516 503 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 TOM1L1O75674 476 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 ANXA13P27216 316 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 OAS2P29728 719 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 NPTX2P47972 431 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 PPP2CBP62714 309 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 PPP2CAP67775 309 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 NOP14P78316 857 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 KCNMA1Q12791 1236 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 CDC20Q12834 499 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 FGL2Q14314 439 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 NR0B2Q15466 257 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 ECM1Q16610 540 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 ZNF542PQ5EBM4 170 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 HECTD3Q5T447 861 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 C20orf194Q5TEA3 1177 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 VSTM1Q6UX27 236 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 CDH24Q86UP0 819 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 CCDC83Q8IWF9 413 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 PDCL2Q8N4E4 241 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 GOLGA1Q92805 767 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 EPAS1Q99814 870 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 OMDQ99983 421 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 MFRPQ9BY79 579 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 CCSER1Q9C0I3 900 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 FBRSQ9HAH7 460 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 CBX8Q9HC52 389 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM16-218ENST00000579843 MAP10Q9P2G4 905 aa7.22□□□□□ -1.25
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