RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 CYFIP2Q96F07 1278 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-210ENST00000578916 WBP1Q96G27 269 aa9.54□□□□□ -0.88
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PTPRM-210ENST00000578916 ORAI3Q9BRQ5 295 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM245Q9H330 911 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-210ENST00000578916 PNPLA8Q9NP80 782 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-210ENST00000578916 PRSS16Q9NQE7 514 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-210ENST00000578916 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-210ENST00000578916 CLIC5Q9NZA1 410 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-210ENST00000578916 HMGXB4Q9UGU5 601 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-210ENST00000578916 STRIP2Q9ULQ0 834 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRM-210ENST00000578916 CLCA2Q9UQC9 943 aa9.54□□□□□ -0.88
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PTPRM-210ENST00000578916 FAM181AQ8N9Y4 354 aa9.53□□□□□ -0.88
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PTPRM-210ENST00000578916 UBE4BO95155 1302 aa9.53□□□□□ -0.88
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PTPRM-210ENST00000578916 USP30Q70CQ3 517 aa9.52□□□□□ -0.89
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PTPRM-210ENST00000578916 RXRGP48443 463 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-210ENST00000578916 HARS2P49590 506 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-210ENST00000578916 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-210ENST00000578916 NXPH1P58417 271 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF445P59923 1031 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-210ENST00000578916 ST8SIA6P61647 398 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-210ENST00000578916 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-210ENST00000578916 E2F1Q01094 437 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRM-210ENST00000578916 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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