RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 RPL34P49207 117 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 NME3Q13232 169 aa20.58■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 KRT72Q14CN4 511 aa20.58■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 SYPL2Q5VXT5 272 aa20.58■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 GPR142Q7Z601 462 aa20.58■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 APPL2Q8NEU8 664 aa20.58■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNK4Q9NYG8 393 aa20.58■□□□□ 0.89
AFG3L1P-217ENST00000557444 H3BRJ5 948 aa20.58■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 TPP1O14773 563 aa20.58■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 RARBP10826 455 aa20.58■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 C4orf22Q6V702 233 aa20.58■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 HFE2Q6ZVN8 426 aa20.58■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 RNF169Q8NCN4 708 aa20.58■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARRDC4Q8NCT1 418 aa20.58■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADAM32Q8TC27 787 aa20.58■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 MKS1Q9NXB0 559 aa20.58■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 EMCNQ9ULC0 261 aa20.58■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 BPTFQ12830 3046 aa20.58■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ITM2AO43736 263 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 SNNO75324 88 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNA4P22459 653 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 GTF2A2P52657 109 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC8A3P57103 927 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 KDSRQ06136 332 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC25A52Q3SY17 297 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 STRADAQ7RTN6 431 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 NME8Q8N427 588 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 RNF139Q8WU17 664 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 SYBUQ9NX95 663 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 CAPN14A8MX76 684 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 B2RBV5 119 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNK1O00180 336 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 EPHX2P34913 555 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 RCN1Q15293 331 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPM1JQ5JR12 505 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATG14Q6ZNE5 492 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 CRLF3Q8IUI8 442 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 TEX9Q8N6V9 391 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 FBXO41Q8TF61 875 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 TUBB6Q9BUF5 446 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRDM12Q9H4Q4 367 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.57■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 SDR42E2A6NKP2 422 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 AMHP03971 560 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 NIPAL4Q0D2K0 466 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 PACS1Q6VY07 963 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIM42Q8IWZ5 723 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 DTX3LQ8TDB6 740 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 HSFY1Q96LI6 401 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 TINF2Q9BSI4 451 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 DCLRE1BQ9H816 532 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRC42Q9Y546 428 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM72CH0Y354 149 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 M0QYT0 321 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP12O75317 370 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ALDH1A2O94788 518 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ERVK-10P10266 1014 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 MLH1P40692 756 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ACADSBP45954 432 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 TAF6P49848 677 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 SERPINB9P50453 376 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 WASHC5Q12768 1159 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 STX3Q13277 289 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 CRYMQ14894 314 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM72AQ5TYM5 149 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 STEAP4Q687X5 459 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM72DQ6L9T8 149 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRC8BQ6P9F7 803 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARCQ7LC44 396 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM72BQ86X60 149 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF567Q8N184 647 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 PGBD4Q96DM1 585 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF778Q96MU6 729 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 RILPQ96NA2 401 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 AGAP3Q96P47 875 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 PIGVQ9NUD9 493 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 GDAP2Q9NXN4 497 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.56■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 LILRA4P59901 499 aa20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 SARNPP82979 210 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms