RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 L1RE1Q9UN81 338 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TREHO43280 583 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 BUB1O43683 1085 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 WFS1O76024 890 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PDGFRBP09619 1106 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ZCCHC18P0CG32 403 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ACADMP11310 421 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DPP6P42658 865 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ASMTP46597 345 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 COPAP53621 1224 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 COPS2P61201 443 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DPYSQ14117 519 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SMUG1Q53HV7 270 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RABGAP1LQ5R372 815 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MICU2Q8IYU8 434 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 IFT43Q96FT9 208 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SP110Q9HB58 689 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TAB2Q9NYJ8 693 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ASIC3Q9UHC3 531 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SLC16A4O15374 487 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 KCNN4O15554 427 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CBX5P45973 191 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 NR5A1Q13285 461 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 NAB1Q13506 487 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 INSCQ1MX18 579 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ATG16L1Q676U5 607 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 KDELC2Q7Z4H8 507 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DEFB128Q7Z7B8 93 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 HLA-CQ95604 372 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TAAR1Q96RJ0 339 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CYTH2Q99418 400 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 IGFLR1Q9H665 355 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CLEC4AQ9UMR7 237 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 Q9Y3F1 56 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MRC1P22897 1456 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PDXKO00764 312 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TLR2O60603 784 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SIN3BO75182 1162 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 FBXO21O94952 628 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 LCP1P13796 627 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 GDI1P31150 447 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SULT2A1Q06520 285 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf88Q6PI97 169 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 KDM7AQ6ZMT4 941 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM5Q71RC9 77 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 C16orf62Q7Z3J2 963 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TICAM1Q8IUC6 712 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ULK2Q8IYT8 1036 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 APOL2Q9BQE5 337 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TPK1Q9H3S4 243 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 WWOXQ9NZC7 414 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DUSP12Q9UNI6 340 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM221A6NGB7 291 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SEPT4O43236 478 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ARIH2O95376 493 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 INHAP05111 366 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RALBP11234 206 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SELPP16109 830 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SREBF1P36956 1147 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TMED2Q15363 201 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CNSTQ6PJW8 725 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MYDGFQ969H8 173 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TP53INP1Q96A56 240 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 COL26A1Q96A83 441 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 OTULINQ96BN8 352 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf50Q9BV19 199 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZMYND12Q9H0C1 365 aa6.46□□□□□ -1.38
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