RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544547.5

LIMS1-215, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 4,461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-215ENST00000544547 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.59□□□□□ -0.07
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LIMS1-215ENST00000544547 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 53.8
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LIMS1-215ENST00000544547 OTUD5Q96G74 571 aa14.57□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.57□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 A0A096LPK6 155 aa14.56□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 USP12O75317 370 aa14.56□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 DGAT1O75907 488 aa14.56□□□□□ -0.08
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LIMS1-215ENST00000544547 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
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