RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 HOXB2P14652 356 aa20.13■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 NTSR1P30989 418 aa20.13■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLA2G4AP47712 749 aa20.13■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 PSEN1P49768 467 aa20.13■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 KDSRQ06136 332 aa20.13■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 LY6G5CQ5SRR4 150 aa20.13■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 SDE2Q6IQ49 451 aa20.13■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 PMF1Q6P1K2 205 aa20.13■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 BHLHA9Q7RTU4 235 aa20.13■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 MIB1Q86YT6 1006 aa20.13■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.13■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa20.13■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 DEC1Q9P2X7 70 aa20.13■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 RASAL2Q9UJF2 1139 aa20.13■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.13■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 CNTN6Q9UQ52 1028 aa20.13■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 BPTFQ12830 3046 aa20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 KCNJ18B7U540 433 aa20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 GREM1O60565 184 aa20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF883P0CG24 379 aa20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 SETSIPP0DME0 302 aa20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 MFAP3P55082 362 aa20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 CYP4F3Q08477 520 aa20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 EFEMP1Q12805 493 aa20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 GRIK2Q13002 908 aa20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 KCNJ12Q14500 433 aa20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 VWA3BQ502W6 1294 aa20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 PM20D1Q6GTS8 502 aa20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 PHTF2Q8N3S3 785 aa20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC35F5Q8WV83 523 aa20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC39A7Q92504 469 aa20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDC6Q99741 560 aa20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 NDST4Q9H3R1 872 aa20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 SIX2Q9NPC8 291 aa20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 CYP8B1Q9UNU6 501 aa20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20.12■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRABD2BA6NFA1 517 aa20.11■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 BECN2A8MW95 431 aa20.11■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 HMBSP08397 361 aa20.11■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP8P40818 1118 aa20.11■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 KLHDC10Q6PID8 442 aa20.11■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa20.11■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 KCTD13Q8WZ19 329 aa20.11■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.11■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 A0A1B0GTW7 788 aa20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 A0A1W2PQF6 199 aa20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 YJEFN3A6XGL0 299 aa20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 E7ENQ6 273 aa20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 MBD3O95983 291 aa20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 ABCG1P45844 678 aa20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 STILQ15468 1287 aa20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 TCP11X2Q5H9J9 407 aa20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 C10orf76Q5T2E6 689 aa20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 DENND1BQ6P3S1 775 aa20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 IL27RAQ6UWB1 636 aa20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 HTR3DQ70Z44 454 aa20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM25Q86YD3 366 aa20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARHGAP18Q8N392 663 aa20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF276Q8N554 614 aa20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 NAT16Q8N8M0 369 aa20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 CLEC4CQ8WTT0 213 aa20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 EDEM1Q92611 657 aa20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.1■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTPRBP23467 1997 aa20.09■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 E9PAM4 449 aa20.09■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 THAP12O43422 761 aa20.09■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 STC2O76061 302 aa20.09■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 CER1O95813 267 aa20.09■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 NDUFV2P19404 249 aa20.09■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 GOLGA8FQ08AF8 430 aa20.09■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa20.09■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 KCNMA1Q12791 1236 aa20.09■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANO4Q32M45 955 aa20.09■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.09■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.09■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.09■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 TERB1Q8NA31 727 aa20.09■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF606Q8WXB4 792 aa20.09■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPHK2Q9NRA0 654 aa20.09■□□□□ 0.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 MARCH2Q9P0N8 246 aa20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms