RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 SLX4Q8IY92 1834 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC171Q6TFL3 1326 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1B0GTW7 788 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 CDHR4A6H8M9 788 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 AHCYL1O43865 530 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 BBOX1O75936 387 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 CFIP05156 583 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 TSHRP16473 764 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 GCSHP23434 173 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 EDNRBP24530 442 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 KLRK1P26718 216 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 LIFRP42702 1097 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 RABEP1Q15276 862 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 GADL1Q6ZQY3 521 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 NEK10Q6ZWH5 1172 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 ARHGEF19Q8IW93 802 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 BRI3BPQ8WY22 251 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 KAT5Q92993 513 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 APIPQ96GX9 242 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 ANKRD2Q9GZV1 360 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 CYP4F11Q9HBI6 524 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 RNF181Q9P0P0 153 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 NOX1Q9Y5S8 564 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 SNX5Q9Y5X3 404 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 SNED1Q8TER0 1413 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 MAST3O60307 1309 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 SMTNL1A8MU46 457 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 FOXN1O15353 648 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 DTNBO60941 627 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 CDKL5O76039 1030 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 PRSS23O95084 383 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 CKBP12277 381 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 XBP1P17861 261 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 KRT4P19013 534 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 SCP2P22307 547 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 GYG1P46976 350 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 NPTX2P47972 431 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 HSPA7P48741 367 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 MEA1Q16626 185 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 CFAP58Q5T655 872 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 ARMC6Q6NXE6 501 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 FOXR2Q6PJQ5 311 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 Q6ZPA2 131 aa4.57□□□□□ -1.68
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PTPRC-214ENST00000530727 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa4.57□□□□□ -1.68
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PTPRC-214ENST00000530727 BTBD1Q9H0C5 482 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 SERHL2Q9H4I8 314 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 STK32BQ9NY57 414 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 CEP83Q9Y592 693 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 SNX14Q9Y5W7 946 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 MARCH11A6NNE9 402 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 GRM6O15303 877 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 P4HA2O15460 535 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 IRAK2O43187 625 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 HAUS5O94927 633 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 GPANK1O95872 356 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 ELANEP08246 267 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 HARSP12081 509 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
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PTPRC-214ENST00000530727 DCAF7P61962 342 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRC-214ENST00000530727 RAB39AQ14964 217 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 MPEG1Q2M385 716 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 ZACNQ401N2 412 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 DSTYKQ6XUX3 929 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 NRSN1Q8IZ57 195 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 GALNT15Q8N3T1 639 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-214ENST00000530727 ARL10Q8N8L6 244 aa4.56□□□□□ -1.68
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