RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RAB2AP61019 212 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NR1D2Q14995 579 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PAOXQ6QHF9 649 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TC2NQ8N9U0 490 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CHMP6Q96FZ7 201 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MXRA8Q9BRK3 442 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 VPS11Q9H270 941 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 JAG2Q9Y219 1238 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 WDR81Q562E7 1941 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ANGPT2O15123 496 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TLR2O60603 784 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UBXN7O94888 489 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FTH1P02794 183 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GJA1P17302 382 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TTPAP49638 278 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CRHR2Q13324 411 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 USP41Q3LFD5 358 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZBED8Q8IZ13 594 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LRRC52Q8N7C0 313 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ACMSDQ8TDX5 336 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NELL2Q99435 816 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MBD2Q9UBB5 411 aa4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CDK2AP1O14519 115 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAUP35544 74 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ARHGDIBP52566 201 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BACE1P56817 501 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CBX1P83916 185 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OTOAQ7RTW8 1153 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HAVCR1Q96D42 359 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DNAJC7Q99615 494 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MRI1Q9BV20 369 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DYRK1BQ9Y463 629 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 WDR91A4D1P6 747 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 VWA5AO00534 786 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 AKAP10O43572 662 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 VNN2O95498 520 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MYL2P10916 166 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRDX6P30041 224 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MAGEA1P43355 309 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RAP1GDS1P52306 607 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 VSNL1P62760 191 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FANCCQ00597 558 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PKP1Q13835 747 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCDC24Q8N4L8 307 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF555Q8NEP9 628 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TM9SF4Q92544 642 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM221BA6H8Z2 402 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NFATC1O95644 943 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CERS6Q6ZMG9 384 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PAQR7Q86WK9 346 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HES6Q96HZ4 224 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 Q96MT0 163 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CLCC1Q96S66 551 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KNTC1P50748 2209 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR56A5P0C7T3 313 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LRRC38Q5VT99 294 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CDK20Q8IZL9 346 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RIPOR3Q96MK2 946 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM175Q9BSA9 504 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GLS2Q9UI32 602 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BBIP1A8MTZ0 92 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A1BGP04217 495 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TSPAN8P19075 237 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 VCAM1P19320 739 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GNA15P30679 374 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BCAR1P56945 870 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PJA1Q8NG27 643 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR6J1Q8NGC5 347 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KCNV2Q8TDN2 545 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BMFQ96LC9 184 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KLHL11Q9NVR0 708 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OGTO15294 1046 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PDE5AO76074 875 aa4.63□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ITGA2BP08514 1039 aa4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.4 ms