RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
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PRAME-213ENST00000492657 PIGVQ9NUD9 493 aa13.26□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 A0A0G2JND7 137 aa13.26□□□□□ -0.29
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PRAME-213ENST00000492657 I6L893 689 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
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PRAME-213ENST00000492657 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP13.26□□□□□ -0.291e-11■■□□□ 11.5
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PRAME-213ENST00000492657 P2RY11Q96G91 374 aa13.25□□□□□ -0.29
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PRAME-213ENST00000492657 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
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PRAME-213ENST00000492657 E7ENQ6 273 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 I3L4J1 428 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 DAB1O75553 588 aa13.25□□□□□ -0.29
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PRAME-213ENST00000492657 TPSB2P20231 275 aa13.25□□□□□ -0.29
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PRAME-213ENST00000492657 SPATA13Q96N96 652 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 PRDM12Q9H4Q4 367 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 CDY2AQ9Y6F7 541 aa13.25□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GVG6 124 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 PSMB4P28070 264 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 NOS2P35228 1153 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 FKBP1BP68106 108 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 IRX4P78413 519 aa13.24□□□□□ -0.29
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