RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486016.1

GCFC2-209, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 3

Gene GCFC2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-209	ENST00000486016	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	OBP2A	Q9NY56	170 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	KRT10	P13645	584 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	ALAD	P13716	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	EXD3	Q8N9H8	876 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	TTC8	Q8TAM2	541 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	KAT2B	Q92831	832 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	COQ9	O75208	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	CHRNB1	P11230	501 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	BFSP2	Q13515	415 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016		Q6ZTC4	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	IFNA2	P01563	188 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	AKR1A1	P14550	325 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	TSHR	P16473	764 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	FGFR2	P21802	821 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	GABRB3	P28472	473 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	DHRS13	Q6UX07	377 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	MEIS3	Q99687	375 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCFC2-209	ENST00000486016		A0A1W2PPC4	97 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	KAT7	O95251	611 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	MT3	P25713	68 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC8A1	P32418	973 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	C14orf80	Q86SX3	495 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	GPR78	Q96P69	363 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	ICK	Q9UPZ9	632 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GCFC2-209	ENST00000486016	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69

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