RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 OR2T3Q8NH03 318 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 KAT5Q92993 513 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 TRIM62Q9BVG3 475 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 ABCB8Q9NUT2 735 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 GGA2Q9UJY4 613 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 CKAP5Q14008 2032 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 A0A1B0GTW7 788 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 CAPN9O14815 690 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 ACSL4O60488 711 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 TBL1XO60907 577 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 HLA-FP30511 346 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 ACADSBP45954 432 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 SEMA3BQ13214 749 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 TRIM59Q8IWR1 403 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 LMO3Q8TAP4 145 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 SERPINB11Q96P15 392 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 UPK3BL1B0FP48 263 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 UPK3BL2E5RIL1 263 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 KRT37O76014 449 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 RING1Q06587 406 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 MPP7Q5T2T1 576 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 TMEM215Q68D42 235 aa20.96■□□□□ 0.95
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ACTB-212ENST00000484841 FAM81BQ96LP2 452 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 LHX5Q9H2C1 402 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 FBRSQ9HAH7 460 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 STIM2Q9P246 746 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-212ENST00000484841 HLA-EP13747 358 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 COPAP53621 1224 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 ST8SIA6P61647 398 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 PIK3R6Q5UE93 754 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 MBLAC2Q68D91 279 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 FAM124AQ86V42 546 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 MFN1Q8IWA4 741 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 SCUBE3Q8IX30 993 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 AZIN2Q96A70 460 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 ZSWIM1Q9BR11 485 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 SUN2Q9UH99 717 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 PCDH15Q96QU1 1955 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 METTL12A8MUP2 240 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 KCNJ18B7U540 433 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 CALCAP01258 141 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 IGLV3-27P01718 113 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 DNTTP04053 509 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 BMP6P22004 513 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 MARSP56192 900 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 SLC14A1Q13336 389 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP20.94■□□□□ 0.941e-24■■■□□ 16.3
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ACTB-212ENST00000484841 SNX19Q92543 992 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 TLR6Q9Y2C9 796 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 GON4LQ3T8J9 2241 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 THAP12O43422 761 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
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ACTB-212ENST00000484841 IGLV3-19P01714 112 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 APOEP02649 317 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 USP8P40818 1118 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 SGSHP51688 502 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 CDH18Q13634 790 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa20.93■□□□□ 0.94
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ACTB-212ENST00000484841 CARNMT1Q8N4J0 409 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 ZNF366Q8N895 744 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 OR2I1PQ8NGU4 316 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 MED15Q96RN5 788 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 PCED1AQ9H1Q7 454 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 TMEM245Q9H330 911 aa20.93■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 GABBR2O75899 941 aa20.92■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 MOCS3O95396 460 aa20.92■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 PROS1P07225 676 aa20.92■□□□□ 0.94
ACTB-212ENST00000484841 GNA15P30679 374 aa20.92■□□□□ 0.94
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