RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 SLC9A1P19634 815 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 SPINK2P20155 84 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 CD6P30203 668 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 GNA15P30679 374 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 SGSHP51688 502 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 UBE2HP62256 183 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 DUOXA1Q1HG43 343 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 GBP6Q6ZN66 633 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 MFN1Q8IWA4 741 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM59Q8IWR1 403 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 CPXM2Q8N436 756 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF276Q8N554 614 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 UBR7Q8N806 425 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 SLC35F5Q8WV83 523 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 KREMEN1Q96MU8 473 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 GABRG3Q99928 467 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 GGA2Q9UJY4 613 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 PILRBQ9UKJ0 227 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-209ENST00000480420 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 E5RJQ4 531 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 H0Y626 953 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 GFRA2O00451 464 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 TIMM44O43615 452 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 ACSL4O60488 711 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 OPHN1O60890 802 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 GABBR2O75899 941 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 APOEP02649 317 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 SYPP08247 313 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 HLA-FP30511 346 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 SLC6A4P31645 630 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 CD70P32970 193 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 DPP6P42658 865 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 TPMTP51580 245 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 ST8SIA6P61647 398 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 RPS24P62847 133 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 GCNT1Q02742 428 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 CDH18Q13634 790 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 E2F5Q15329 346 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 DCAF6Q58WW2 860 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 WDR45BQ5MNZ6 344 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 RAP1GAP2Q684P5 730 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 NUGGCQ68CJ6 796 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM215Q68D42 235 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 MBLAC2Q68D91 279 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 OR6B2Q6IFH4 312 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM65Q6PJ69 517 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 BHLHA9Q7RTU4 235 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 CHSY1Q86X52 802 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 LGI2Q8N0V4 545 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 LMO3Q8TAP4 145 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 CEP76Q8TAP6 659 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF606Q8WXB4 792 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 IRGQQ8WZA9 623 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 HSFY1Q96LI6 401 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 SERPINB11Q96P15 392 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 SLC2A11Q9BYW1 496 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 MTG2Q9H4K7 406 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 SLC32A1Q9H598 525 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 PLCB1Q9NQ66 1216 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 CHMP5Q9NZZ3 219 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 RWDD2AQ9UIY3 292 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 PKD1L2Q7Z442 2459 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 NUMA1Q14980 2115 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 CKAP5Q14008 2032 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 TM4SF5O14894 197 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 BNIP3LO60238 219 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 FSBPO95073 299 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 SERPINF2P08697 491 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
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