RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477054.6

GSDMB-208, Transcript of gasdermin B, humanhuman

TSL 5

Gene GSDMB, Length 4,655 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMB-208ENST00000477054 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 CCDC153Q494R4 210 aa10□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 TREML2Q5T2D2 321 aa10□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 UNC45BQ8IWX7 931 aa10□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa10□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 DDHD1Q8NEL9 900 aa10□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 CDCA5Q96FF9 252 aa10□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 BORCS6Q96GS4 357 aa10□□□□□ -0.81
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GSDMB-208ENST00000477054 KCNK4Q9NYG8 393 aa10□□□□□ -0.81
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GSDMB-208ENST00000477054 MFSD10Q14728 455 aa10□□□□□ -0.81
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GSDMB-208ENST00000477054 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa10□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 SLCO1B7G3V0H7 640 aa10□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 ERBB2P04626 1255 aa10□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 CDKN2BP42772 138 aa10□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 MMRN1Q13201 1228 aa10□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 AGAP9Q5VTM2 703 aa10□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 SLCO2A1Q92959 643 aa10□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 CCDC126Q96EE4 140 aa10□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 FAR2Q96K12 515 aa10□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 SPATA13Q96N96 652 aa10□□□□□ -0.81
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GSDMB-208ENST00000477054 ZNF536O15090 1300 aa9.99□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.818e-9■■■□□ 18.3
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GSDMB-208ENST00000477054 IL10P22301 178 aa9.99□□□□□ -0.81
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GSDMB-208ENST00000477054 SCNN1BP51168 640 aa9.99□□□□□ -0.81
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GSDMB-208ENST00000477054 CBX3Q13185 183 aa9.99□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 ACVR2BQ13705 512 aa9.99□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 SEL1L3Q68CR1 1132 aa9.99□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 TAS2R42Q7RTR8 314 aa9.99□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 XYLT1Q86Y38 959 aa9.99□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 ARL10Q8N8L6 244 aa9.99□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa9.99□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9.99□□□□□ -0.81
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GSDMB-208ENST00000477054 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa9.99□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 POPDC2Q9HBU9 364 aa9.99□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 SRP72O76094 671 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
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GSDMB-208ENST00000477054 GRM5P41594 1212 aa9.99□□□□□ -0.81
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GSDMB-208ENST00000477054 CEP41Q9BYV8 373 aa9.99□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 GID8Q9NWU2 228 aa9.99□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 ACOT9Q9Y305 439 aa9.99□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 CLUHO75153 1309 aa9.99□□□□□ -0.81
GSDMB-208ENST00000477054 KPNA6O60684 536 aa9.99□□□□□ -0.81
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