RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 TNIP3Q96KP6 325 aa21.08■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 BATF3Q9NR55 127 aa21.08■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 GDAP2Q9NXN4 497 aa21.08■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 BIRC5O15392 142 aa21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 RARBP10826 455 aa21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 MLNP12872 115 aa21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 CDC42EP1Q00587 391 aa21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 NME3Q13232 169 aa21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 RCN2Q14257 317 aa21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 LRRC8BQ6P9F7 803 aa21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 TIFABQ6ZNK6 161 aa21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 GPR142Q7Z601 462 aa21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 TMEM40Q8WWA1 233 aa21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 RILPQ96NA2 401 aa21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD27Q96NW4 1050 aa21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 DNAI2Q9GZS0 605 aa21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 BTBD19C9JJ37 291 aa21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 H3BRJ5 948 aa21.07■□□□□ 0.96
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IMP4-208ENST00000460766 SNNO75324 88 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 ALDH1A2O94788 518 aa21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 PSMB4P28070 264 aa21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 EPHX2P34913 555 aa21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 PNPLA4P41247 253 aa21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 CCDC6Q16204 474 aa21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 STEAP4Q687X5 459 aa21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 CYS1Q717R9 158 aa21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 DNAJB3Q8WWF6 145 aa21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 FERMT1Q9BQL6 677 aa21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 TINF2Q9BSI4 451 aa21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 NRCAMQ92823 1304 aa21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 TPP1O14773 563 aa21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 OPHN1O60890 802 aa21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 PACS1Q6VY07 963 aa21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 TREML1Q86YW5 311 aa21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 LRRC42Q9Y546 428 aa21.07■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 CAPN14A8MX76 684 aa21.06■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 B2RBV5 119 aa21.06■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 M0QYT0 321 aa21.06■□□□□ 0.96
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IMP4-208ENST00000460766 RCN1Q15293 331 aa21.06■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 SV2CQ496J9 727 aa21.06■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 ACSBG2Q5FVE4 666 aa21.06■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 FAM91A1Q658Y4 838 aa21.06■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 PGBD4Q96DM1 585 aa21.06■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 FAM167BQ9BTA0 163 aa21.06■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 THAP1Q9NVV9 213 aa21.06■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 DAB1O75553 588 aa21.05■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 BEST1O76090 585 aa21.05■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 PGAM1P18669 254 aa21.05■□□□□ 0.96
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IMP4-208ENST00000460766 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
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IMP4-208ENST00000460766 DUSP16Q9BY84 665 aa21.05■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 PRDM12Q9H4Q4 367 aa21.05■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 PSAT1Q9Y617 370 aa21.05■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.05■□□□□ 0.96
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IMP4-208ENST00000460766 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 PDE1BQ01064 536 aa21.05■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 PDK1Q15118 436 aa21.05■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 CCL15Q16663 113 aa21.05■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.05■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 ATP2A3Q93084 1043 aa21.05■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 LRRC4Q9HBW1 653 aa21.05■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 SYBUQ9NX95 663 aa21.05■□□□□ 0.96
IMP4-208ENST00000460766 LILRA4P59901 499 aa21.04■□□□□ 0.96
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