RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ITGAXP20702 1163 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PCYT1AP49585 367 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PEX3P56589 373 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 DLG4P78352 724 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 FMO1Q01740 532 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 FAAP100Q0VG06 881 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 MORF4L2Q15014 288 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 NRF1Q16656 503 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHL38Q2WGJ6 581 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM182AQ5T1J6 154 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 RTL10Q7L3V2 364 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CATSPER3Q86XQ3 398 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 RHPN2Q8IUC4 686 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PALM2Q8IXS6 379 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 LMO3Q8TAP4 145 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 BHMTQ93088 406 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 EME1Q96AY2 570 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 NACC2Q96BF6 587 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC17Q96LX7 622 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CDC14AQ9UNH5 594 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 JAG2Q9Y219 1238 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SIP14410 1827 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PQ67 120 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PI4K2BG5E9Z4 385 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 AQP9O43315 295 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX2O60749 519 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SIN3BO75182 1162 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO21O94952 628 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CALCAP01258 141 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC130P13994 396 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PRDX6P30041 224 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SHMT1P34896 483 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ADGRE1Q14246 886 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNJ8Q15842 424 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC142Q17RM4 750 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 BMT2Q1RMZ1 405 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 FNBP1LQ5T0N5 605 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 RSPH3Q86UC2 560 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR180Q86V85 440 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM151BQ8IW70 566 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO36Q8NEA4 188 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CHPT1Q8WUD6 406 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 DCAF4Q8WV16 495 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 DHRS4Q9BTZ2 278 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 BRINP2Q9C0B6 783 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CEP44Q9C0F1 390 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 NYAP2Q9P242 653 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 DNM3Q9UQ16 869 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF11Q9Y3C5 154 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF536O15090 1300 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC162PA2VCL2 907 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 A8MU76 341 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 KLF11O14901 512 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PRMT3O60678 531 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ATE1O95260 518 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ALDH1A1P00352 501 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 NCAM1P13591 858 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CD247P20963 164 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 TM4SF4P48230 202 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 GSSP48637 474 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 STAT2P52630 851 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 TAS2R40P59535 323 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBTB17Q13105 803 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 NOGQ13253 232 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 NR1D2Q14995 579 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 AMHR2Q16671 573 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 BBS9Q3SYG4 887 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ATG16L1Q676U5 607 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 FRMD7Q6ZUT3 714 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR141Q7Z602 305 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 NUDCD3Q8IVD9 361 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ASIC4Q96FT7 647 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SERINC2Q96SA4 455 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC13A1Q9BZW2 595 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 EHD1Q9H4M9 534 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 EPS15L1Q9UBC2 864 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PPW3 197 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 LIASO43766 372 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 H6PDO95479 791 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-203ENST00000439720 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms