RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 SDSP20132 328 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 PTMSP20962 102 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 FBLP22087 321 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 CCND2P30279 289 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 CLCN4P51793 760 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 PARM1Q6UWI2 310 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 NME8Q8N427 588 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 CASD1Q96PB1 797 aa6.95□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 TMX1Q9H3N1 280 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 DCTPP1Q9H773 170 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 ERAP1Q9NZ08 941 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 STK39Q9UEW8 545 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 KLK13Q9UKR3 277 aa6.95□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 EPN2O95208 641 aa6.94□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 CCDC192P0DO97 292 aa6.94□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 SCAPQ12770 1279 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 SQSTM1Q13501 440 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 METTL7BQ6UX53 244 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 ITPRIPQ8IWB1 547 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 SSH3Q8TE77 659 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 FGF14Q92915 247 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 C22orf23Q9BZE7 217 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 ZMAT4Q9H898 229 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 COL20A1Q9P218 1284 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 DENND4AQ7Z401 1863 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 PLIN4Q96Q06 1357 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 AHRRA9YTQ3 701 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 RHOBTB3O94955 611 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 NUDT3O95989 172 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 GLUD1P00367 558 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 TOP1P11387 765 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 TDGF1P13385 188 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 MPLP40238 635 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 AK2P54819 239 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 FAM189BP81408 668 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 SATB1Q01826 763 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 WTAPQ15007 396 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 PTPAQ15257 358 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 CLEC17AQ6ZS10 378 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 SKAP1Q86WV1 359 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRK-211ENST00000429595 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 BOLA2Q9H3K6 86 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM9BQ9NQ34 198 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 HEBP1Q9NRV9 189 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 TOMM22Q9NS69 142 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 OXSMQ9NWU1 459 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 CHMP5Q9NZZ3 219 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 CDH7Q9ULB5 785 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 TNNQ9UQP3 1299 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM24O15164 1050 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 NMT2O60551 498 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 RFPL2O75678 378 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 RPP40O75818 363 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-211ENST00000429595 FSBPO95073 299 aa6.92□□□□□ -1.3
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