RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MT-CO3P00414 261 aa17.31■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WNT1P04628 370 aa17.31■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 P4HA1P13674 534 aa17.31■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GALCP54803 685 aa17.31■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MPPE1Q53F39 396 aa17.31■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UNC93AQ86WB7 457 aa17.31■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DENND1CQ8IV53 801 aa17.31■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF366Q8N895 744 aa17.31■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HHLA1C9JL84 531 aa17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLK10O43240 276 aa17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HMBSP08397 361 aa17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NXPH1P58417 271 aa17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLEC20AQ6ZU45 233 aa17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHST9Q7L1S5 443 aa17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC186Q7Z3E2 898 aa17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM217AQ8IXS0 508 aa17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AHI1Q8N157 1196 aa17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 XXYLT1Q8NBI6 393 aa17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF516Q92618 1163 aa17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 JAKMIP2Q96AA8 810 aa17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM49BQ9NUQ9 324 aa17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXL12Q9NXK8 326 aa17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL17BQ9UHF5 180 aa17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STRIP2Q9ULQ0 834 aa17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1W2PR77 199 aa17.29■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TLR4O00206 839 aa17.29■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STX6O43752 255 aa17.29■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DLDP09622 509 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADORA2BP29275 332 aa17.29■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HLA-FP30511 346 aa17.29■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCR5P51681 352 aa17.29■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF11P52732 1056 aa17.29■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AP3M2P53677 418 aa17.29■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF445P59923 1031 aa17.29■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EFEMP1Q12805 493 aa17.29■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BNIP3Q12983 259 aa17.29■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BIRC3Q13489 604 aa17.29■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NCEH1Q6PIU2 408 aa17.29■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCD5Q86SK9 330 aa17.29■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR2T34Q8NGX1 318 aa17.29■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa17.29■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP17.28■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MPOP05164 745 aa17.28■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LSSP48449 732 aa17.28■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDST1P52848 882 aa17.28■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GABREP78334 506 aa17.28■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NCOA4Q13772 614 aa17.28■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PROX2Q3B8N5 592 aa17.28■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BRAPQ7Z569 592 aa17.28■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGAP18Q8N392 663 aa17.28■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP17.28■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C12orf29Q8N999 325 aa17.28■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM117AQ9C073 453 aa17.28■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SDCBP2Q9H190 292 aa17.28■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EBF2Q9HAK2 575 aa17.28■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 THSD1Q9NS62 852 aa17.28■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MARCH2Q9P0N8 246 aa17.28■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FZD4Q9ULV1 537 aa17.28■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa17.28■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa17.28■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTPN13Q12923 2485 aa17.27■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAGEC1O60732 1142 aa17.27■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STAT6P42226 847 aa17.27■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYP2J2P51589 502 aa17.27■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HS1BP3Q53T59 392 aa17.27■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa17.27■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADIPOR2Q86V24 386 aa17.27■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLD4Q96BZ4 506 aa17.27■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SERAC1Q96JX3 654 aa17.27■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DEPDC7Q96QD5 511 aa17.27■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa17.27■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCB8Q9NUT2 735 aa17.27■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GGA2Q9UJY4 613 aa17.27■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SSUH2Q9Y2M2 353 aa17.27■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP3Q9Y6I4 520 aa17.27■□□□□ 0.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLXNA2O75051 1894 aa17.27■□□□□ 0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 K7ENP7 123 aa17.26■□□□□ 0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GJB2P29033 226 aa17.26■□□□□ 0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HOXD13P35453 343 aa17.26■□□□□ 0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ASIC1P78348 528 aa17.26■□□□□ 0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DAB2P98082 770 aa17.26■□□□□ 0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa17.26■□□□□ 0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MBLAC2Q68D91 279 aa17.26■□□□□ 0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms