RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSCBQ8IWL3 235 aa13.75□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXL13Q8NEE6 735 aa13.75□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa13.75□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDC6Q99741 560 aa13.75□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM245Q9H330 911 aa13.75□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STOML2Q9UJZ1 356 aa13.75□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TULP2O00295 520 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPAN3O60637 253 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYKP43405 635 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCAT1P54687 386 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDE4CQ08493 712 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPYDQ12882 1025 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIF19Q2TAC6 998 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COL28A1Q2UY09 1125 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHST9Q7L1S5 443 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDZD3Q86UT5 571 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AHI1Q8N157 1196 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF366Q8N895 744 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHBDD1Q8TEB9 315 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBRSQ9HAH7 460 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC4Q9HBW1 653 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OSGEPQ9NPF4 335 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB20Q9NX57 234 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPAN16Q9UKR8 245 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BTBD3Q9Y2F9 522 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APC2O95996 2303 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACACAQ13085 2346 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STX10O60499 249 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEMA4FO95754 770 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LATS1O95835 1130 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRIA4P48058 902 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADIGQ0VDE8 80 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BST2Q10589 180 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEAD4Q15561 434 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTPRNQ16849 979 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EDRF1Q3B7T1 1238 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADIPOR2Q86V24 386 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF139Q8WU17 664 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TATDN2Q93075 761 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPATA32Q96LK8 384 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BTBD1Q9H0C5 482 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TM9SF3Q9HD45 589 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCB8Q9NUT2 735 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GGA2Q9UJY4 613 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLA2G4CQ9UP65 541 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAXQ9Y2V3 346 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX11Q9Y5W9 270 aa13.74□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNTTP04053 509 aa13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPB41P11171 864 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCT8P50990 548 aa13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFA8P51970 172 aa13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS14P62263 151 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBTB16Q05516 673 aa13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADGRF1Q5T601 910 aa13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BSPRYQ5W0U4 402 aa13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LAYNQ6UX15 382 aa13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EDEM1Q92611 657 aa13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BIRC7Q96CA5 298 aa13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRSS16Q9NQE7 514 aa13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DKK4Q9UBT3 224 aa13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HESX1Q9UBX0 185 aa13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa13.73□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLXNA2O75051 1894 aa13.72□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA8CPA6NN73 597 aa13.72□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YJEFN3A6XGL0 299 aa13.72□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 E7ENQ6 273 aa13.72□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MSI1O43347 362 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DLDP09622 509 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRK6P43250 576 aa13.72□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SGSHP51688 502 aa13.72□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CUL2Q13617 745 aa13.72□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SGO2Q562F6 1265 aa13.72□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MBLAC2Q68D91 279 aa13.72□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALNT15Q8N3T1 639 aa13.72□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGSF8Q969P0 613 aa13.72□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EEF2KMTQ96G04 330 aa13.72□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SGK2Q9HBY8 427 aa13.72□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCC13Q9NSE7 274 aa13.72□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa13.71□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CETN3O15182 167 aa13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms